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比较两个文件中的列名

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比较两个文件中的列名

我的第一个文件有 1099 列

#rnaseq/SNPID   hg19Location    Gene    TCGA-BH-A0C0-01A        TCGA-A2-A3XY-01A        TCGA-XX-A89A-01A   TCGA-B6-A0I2-01A TCGA-LL-A6FP-01A        TCGA-EW- 
rnaseq  -       ?|100133144     7.8666  9.6884  22.3240 1.8760  2.0161  7.8383  5.3991  0.0857  4.5513  15.4363     15.0035 4.3578  0.6809  2.5364  12.4086 11.5839

我想要比较的列从第 3 列开始

TCGA-BH-A0C0-01A        TCGA-A2-A3XY-01A        TCGA-XX-A89A-01A   TCGA-B6-A0I2-01A TCGA-LL-A6FP-01A        TCGA-EW-

第二个文件有 1119 列

 [1]#SNPID  hg19Location    Gene    AlleleA AlleleB dbSNP   nSample TCGA-AC-A3TN-01A-11D-A227-01    TCGA-V7-A7HQ-01A-11D-A33D-01    TCGA-BH-A18R-01A- 
[2]SNP_A-1780270   chr7:78599583:- MAGI2|ENSG00000187391.13        C       G      rs987435 2236    1_0.002700      1_0.006000      1_0.000300

我想要比较的列从第 8 列开始

TCGA-AC-A3TN-01A-11D-A227-01    TCGA-V7-A7HQ-01A-11D-A33D-01    TCGA-BH-A18R-01A-

这样我想将第一个文件中的列名称与第二个文件中的列名称相匹配，以便第二个文件仅具有与第一个文件相同的列名称

所以基本上我希望两个文件中具有相同的列名

答案1

您只想对一个文件执行此操作吗？另外，列是否由标准的东西（例如制表符或逗号）分隔？如果这些都是真的，最简单的方法可能是在 LibreOffice Calc 中打开文件，将分隔符设置为任何内容（例如制表符），然后将所需的列从一个文件复制到另一个文件。如果使用 LibreOffice 打开文件时没有要求您设置分隔符，请将文件重命名为.csvfirst.

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