我插入了一个外部硬盘，然后出现了一些在 Windows 上隐藏的文件夹（$RECYCLE.BIN和System Volume Information），请参阅我的屏幕截图。我不确定删除它们是否安全，但是有没有办法在 Ubuntu 上隐藏这些文件夹？
答案1
您可以删除这些文件夹，这不会造成任何损害，但 Windows 每次接触该驱动器时都会将它们放回原处。
如果您打算在此硬盘上使用 Windows 和 Ubuntu，您可能需要.hidden在驱动器的根目录中创建一个文件。在此文件中，写入您希望文件管理器隐藏的文件的名称，如下所示：
$RECYCLE.BIN
System Volume Information
然后保存并重新启动文件管理器。请注意，这仅适用于某些 Linux 文件管理器；此外，如果您的 Windows PC 设置为显示隐藏文件，则该.hidden文件可能会显示在文件资源管理器中。
答案2
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好吧，Ian Klug 的回答更简短，更切中要点。你可以跳过我的，哈哈哈。
这些是什么？
$RECYCLE.BIN是回收站的位置。它有一个文件夹，其中包含回收站的内容以及这些文件的元数据（图标、原始路径等）。插入 Windows 的每个存储分区都会有一个（主驱动器也是如此）。回收站文件夹视图允许您查看$RECYCLE.BIN当前插入的每个驱动器的内容。
我从来没有深入研究过System Volume Information，但有一个旧 Microsoft 文章和一个维基百科文章谈论一下这个。
默认情况下，它们在 Windows 中是隐藏的，但您可以配置文件夹资源管理器来查看它们。
删除它们安全吗？
从主驱动器（安装 Windows 的驱动器）中删除它们可能会造成严重后果。不过，从外部驱动器中删除它们不会造成任何问题。
回收站仅包含您已处理（通过拖动或按 Delete 键）但尚未实际删除的文件。如果您确定那里的所有文件都是垃圾，则可以删除整个文件夹。
如果您想检查是否有有用的内容，只需打开它。您删除的文件没有经过任何加密，它们是子文件夹中的普通文件$RECYCLE.BIN。（任何子文件夹之外可能有一个奇怪的文件，但它只是已删除文件的元数据）。您可以从那里剪切并粘贴有用的文件，然后删除文件夹的其余部分。
System Volume Information我已经多次从外部驱动器中删除内容，也从未遇到任何问题。在外部驱动器中，它应该包含日志chkdsk，而其他内容很少。（我可能会在稍后使用 U 盘进行一些测试时编辑此帖子）。
删除它将确实不会影响你的 Windows 分区，确实不会破坏您的磁盘分区，也不会影响磁盘中的数据。（或许如果您使用奇怪的 Windows 特定加密或备份程序，但如果您可以在 Linux 中读取文件，那就不太可能了）。
如果您仍然不确定，只需将它们复制到其他地方或重命名即可。它们和其他文件一样都是普通文件夹和文件，将它们还原到磁盘即可消除任何损坏。
你能隐藏它吗？（你的实际问题）
嗯...Linux 没有像 Windows 那样的“隐藏”文件属性。当文件（或文件夹）的名称以点 ( .) 开头时，Linux 程序会将其视为隐藏文件。
然后重命名以包含点将会隐藏它，但下次将硬盘插入 Windows 时，它将再次创建$RECYCLE.BIN（System Volume Information同时保持.$RECYCLE.BIN完整System Volume Information）。
要隐藏$RECYCLE.BIN，System Volume Information您需要配置文件夹系统来识别这些名称，并隐藏它们（但您仍然可以从命令行看到它们）。
您正在使用 Ubuntu 16.04 的默认文件管理器......那是 Nautilus，对吗？
你真幸运。我真的以为你需要安装一个扩展，直到我发现这个。它适用于旧版本的 Nautilus，我也无法测试它（我使用的是 Ubuntu 17.10），所以你必须自己尝试一下。
那么.Trash文件夹是什么？
如果您在 Windows 中看到.Trash或.Trash-1000文件夹，则这是相反的现象：Nautilus 在您的驱动器中安装了一个回收站，并且它在 Windows 中没有隐藏。您仍然可以安全地删除它。
我已经有好几年没见过这个名字了，所以我不确定是否还有任何程序可以做到这一点，但它可能会发生。