计算每行中特定字符串的数量

Question

我有一个 SNP 表，如下所示

A N N N N N N N N N N N
N C N N N C N N N N N N
N N N N N N N N N N N N
N C N N N C N N N N N N
N N N N N N N N N N N N
C C N N N N N N N N N N
C C N N N C C N N N N N
N N N N N N N N N N N N

我想统计每行的N总数？知道怎么做吗

Answer 1

和awk。

awk -F\N '{print NF-1}' infile

或者。

awk -F\N '$0=NF-1' infile

或者。

awk '{print gsub(/\<N\>/, "")}' infile

或者确定在哪一行：

awk -F\N '$0="line "NR": "NF-1' infile

Answer 2

如果您只想计算N每行中特定字符的出现次数，那么

perl -lne 'print tr/N//' infile

如果您想更严格，并计算完全由 string 组成的空白分隔列的数量N，那么

perl -alne 'print scalar grep { $_ eq "N" } @F' infile