如何增加 Rstudio 在集群上使用的内存限制和核心数量

如何增加 Rstudio 在集群上使用的内存限制和核心数量

我在集群 ( ) 上启动Rstudio使用:FastXRivannaCentOS Linux release 7.3.1611 (Core)

https://arcs.virginia.edu/rivanna

这样做的主要目标是显着提高计算速度和内存限制,但是,当我启动计算时,它们非常慢,甚至比我的本地计算机上还要慢。此外,内存限制也非常低,所以我遇到了一个问题:

> sce <- newSCESet(countData=UMI_count)
Error in asMethod(object) : 
Cholmod error 'out of memory' at file ../Core/cholmod_memory.c

似乎我需要指定一些额外的设置来增加 Rstudio 可以使用的内核和内存的数量。我怎么能这么做呢?

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