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从 shell 命令输出中取消所有 SLURM 作业的最佳方法

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从 shell 命令输出中取消所有 SLURM 作业的最佳方法

我提交了很多带有调试时间限制的 SLURM 作业脚本（我忘记更改实际运行的时间）。现在都是同时提交的，所以都是以job ID 197xxxxx开头。现在，我可以做

squeue -u $USER | grep 197 | awk '{print $1}'

打印我想要删除的作业 ID。但是我如何在所有这些 ID 上使用 scancel 命令。上述 shell 命令的输出如下所示

19726664
19726663
19726662
19726661
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答案1

squeue -u $USER | grep ^197 | awk '{print $1}' | xargs -n 1 scancel

查看文档了解xargs详细信息。如果scancel接受多个作业 ID（应该如此），您可以省略该-n 1部分。

答案2

为了取消我所有的 slurm 作业（省略 OP grep 197），我发现我必须修剪 squeue 输出的第一行，其中包含列标题，还：

squeue -u $USER | awk '{print $1}' | tail -n+2 | xargs scancel

答案3

这是我一般使用的：

  1. 取消我所有的工作：

    scancel -u <my_user_name>

  2. 通过过滤取消：即取消所有 jobId 以 26699 开头的作业）：

    squeue --format="%.18i" --me -h | grep -w 26699.* | xargs scancel

答案4

由于这是一个简化的解决方案，您还可以这样做：

squeue -u $USER -h | awk '{print $1}' | xargs scancel

这会省略格式选项，而是删除带有-h标志的标题。

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