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递归地将文件名重命名为更简单的名称

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递归地将文件名重命名为更简单的名称

我的文件名如下所示：

A06_S6_L001_R1_001.fastq
A06_S6_L001_R2_001.fastq
B07_S6_L001_R1_001.fastq
B07_S6_L001_R2_001.fastq
C08_S6_L001_R1_001.fastq
C08_S6_L001_R2_001.fastq

而且我要：

1A06.R1.fastq
1A06.R2.fastq
1B07.R1.fastq
1B07.R2.fastq
etc...

换句话说，我想保留第一个下划线之前的部分，最后一个下划线之前的部分，.在它们之间放置一个，保留文件扩展名并在整个内容前面放置一个数字。我有 perl 重命名，所以我猜最好使用这个命令，但我不知道正则表达式...

答案1

prename方法：

prename -n 's/^([^_]+)_.*_([^_]+)_[0-9]+\./1$1.$2./' *.fastq

( -n-没有行动;显示哪些文件将被重命名）

答案2

使用 bash 和dirname并假设1作为前导前缀：

shopt -s globstar
for file in ./**/*.fastq
do
  [[ $file =~ (...)_(..)_(....)_(..)_(...).fastq ]] && 
  printf "%s\n" "mv -- "$file" "$(dirname "$file")"/1${BASH_REMATCH[1]}.${BASH_REMATCH[4]}.fastq"
done

并使用此示例“输入”：

touch A06_S6_L001_R1_001.fastq A06_S6_L001_R2_001.fastq B07_S6_L001_R1_001.fastq B07_S6_L001_R2_001.fastq C08_S6_L001_R1_001.fastq C08_S6_L001_R2_001.fastq
mkdir subdir
cp *.fastq subdir/

这是结果输出：

mv ./A06_S6_L001_R1_001.fastq ./1A06.R1.fastq
mv ./A06_S6_L001_R2_001.fastq ./1A06.R2.fastq
mv ./B07_S6_L001_R1_001.fastq ./1B07.R1.fastq
mv ./B07_S6_L001_R2_001.fastq ./1B07.R2.fastq
mv ./C08_S6_L001_R1_001.fastq ./1C08.R1.fastq
mv ./C08_S6_L001_R2_001.fastq ./1C08.R2.fastq
mv ./subdir/A06_S6_L001_R1_001.fastq ./subdir/1A06.R1.fastq
mv ./subdir/A06_S6_L001_R2_001.fastq ./subdir/1A06.R2.fastq
mv ./subdir/B07_S6_L001_R1_001.fastq ./subdir/1B07.R1.fastq
mv ./subdir/B07_S6_L001_R2_001.fastq ./subdir/1B07.R2.fastq
mv ./subdir/C08_S6_L001_R1_001.fastq ./subdir/1C08.R1.fastq
mv ./subdir/C08_S6_L001_R2_001.fastq ./subdir/1C08.R2.fastq

printf "%s\n"如果结果看起来正确，请删除。

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