尝试将特定文件复制到特定文件夹

Question

该脚本将所有文件复制到所有文件夹。但我正在努力构建一个条件语句来指定每个文件复制到哪个文件夹。我已经尝试过 if 语句，但根本没有复制。

我使用参数扩展的原因是因为文件名类似于 Long_John_Silver、Miss_Havisham 和 Master_Pip，文件夹名称类似于 Long、Miss 和 Master。因此，本质上我试图将文件复制到各自的文件夹，例如将 Master_Pip.fna.gz 复制到名为 Master 的文件夹中。因此，我尝试做的就是捕获文件名的第一个单词，并以某种方式将其用作参考。

for fldr in /home/scripts/playground/genomes_2/* ; do
    find . -name *fna.gz | while read f ; do
        basenm=${fldr##*/} ; f_name=${basenm%%_*} ; 
        cp -r $f /home/scripts/playground/port/$f_name/ ;
    done
done

这是我的带有 if 语句的脚本，但该脚本根本不复制任何内容。

for fldr in /home/scripts/playground/genomes_2/* ; do
    find . -name *fna.gz | while read f ; do
        basenm=${fldr##*/} ; f_name=${basenm%%_*} ; 
        if [ "$f_name" == /home/scripts/playground/port/"$f_name" ] ; then
            cp -r $f /home/scripts/playground/port/"$f_name"/ ;
        else
            continue    
        fi
    done
done

Answer 1

1.更改此代码

basenm=${fldr##*/};

到这个

basenm=${f##*/} ;

并从复制命令中删除 -r 开关

cp $f /home/scripts/playground/port/"$f_name"

也许您有一些混乱的源路径，例如 /home/scripts/playground/genomes_2/Long_John_Silver/Master_Pip.fna.gz。因此，当您从文件夹名称中提取 f_name 时，fldr您会得到“长”。然后将 Master_Pip.fna.gz 复制到 ..../Long 文件夹。 2.

“$f_name”== /home/scripts/playground/port/“$f_name”

他们不平等，也不会平等。

基本上，你的第一个脚本很好。条件是多余的，因为您通过参数扩展隐式地执行它。

我只会在复制之前添加目录创建命令。这样，如果源目录中出现新人（例如 Shorty_Pete），您始终有一个目录可以复制到该目录。

mkdir -p /home/scripts/playground/port/"$f_name"
cp ...

Answer 2

我意识到我正在根据文件类型（即 .fna.gz）将所有文件复制到所有文件夹中，因此我指定了要读取然后复制的 fna.gz 文件类型。不需要 if 语句，因为特殊性是通过参数扩展隐含的。现在它工作得很好。

for fldr in /home/scripts/playground/genomes_2/* ; do

basenm=${fldr##*/} ; f_name=${basenm%%_*} ; 

find . -name $f_name*fna.gz | while read f ; do

    cp -r $f /home/scripts/playground/port/$f_name/ ;



done

done