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将嵌套目录中的特定文件递归移动到从路径派生的名称

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将嵌套目录中的特定文件递归移动到从路径派生的名称

我在不同的嵌套目录中有一些文件。所有文件均命名为Analysis.mzXML.我希望将它们全部放在一处，同时根据之前保存的目录将每个名称更改为不同的名称。

我知道移动文件并为其指定目录名称已在其他问题中显示过，例如这,这和这。

然而，他们仅使用程序将其移出一个目录，并且仅根据该目录更改名称。就我而言，我希望使用嵌套目录的整个路径来重命名文件

文件全部保存如下：

/dir1/dir2/dir3/dir4/dir5/dir6/Analysis.mzXML

每个都Analysis.mzXML嵌套在不同名称的文件夹中。然而，dir6所有文件碰巧具有相同的名称，并且由于它没有提供有价值的信息，我想跳过它。

我的期望是，通过运行一些命令或脚本，我可以获得所有这些文件，并以其特定路径命名，如下所示：

/dir1_dir2_dir3_dir4_dir5.mzXML

我刚刚开始使用 bash，我不知道如何解决这个问题。

答案1

正如所写的，您的问题表明您想要在整个文件系统中搜索Analysis.mzXML文件，即使它们出现在/lib/perl5/5.14/Unicode/Collate/Locale、 /proc/sys/net/ipv4/conf/all、/sys/devices/system/cpu/cpu0/cache、 /usr/share/doc/cmake/html/_sources或类似不太可能/不适当的位置 - 并且您想要将文件移动到根目录中，这也似乎不太可能/不合适。我假设您正在其他目录中工作。

运行这个命令：

find . -mindepth 7 -maxdepth 7 -type f -name Analysis.mzXML -exec sh -c 'for arg do echo mv -i -- "$arg" "$(echo "$arg" | sed -e "s|^\./||" -e "s|/dir6/Analysis\.mzXML|.mzXML|" -e "s|/|_|g")"; done' sh {} +

-mindepth 7 -maxdepth 7 如果您确定所有Analysis.mzXML文件都位于第七层，则可以省略。此命令查找Analysis.mzXML第七层的所有文件并将它们传递给迷你 shell 脚本。这会获取每个路径名，去掉./开头和dir6结尾的 以及Analysis文件名的一部分，并将所有剩余/字符更改为_.这应该产生如下输出：

mv -i -- ./dir1/dir2/dir3/dir4/dir5/dir6/Analysis.mzXML dir1_dir2_dir3_dir4_dir5.mzXML
mv -i -- ./the/quick/brown/fox/jumps/dir6/Analysis.mzXML the_quick_brown_fox_jumps.mzXML
mv -i -- ./over/the/lazy/dog/foo bar/dir6/Analysis.mzXML over_the_lazy_dog_foo bar.mzXML

如果这看起来正确，请再次运行该命令，但删除第一个命令echo（即更改echo mv为 just mv）。

笔记：

  • 这并不能验证第六级目录是否实际被调用dir6。如果它Analysis.mzXML在 中找到文件dir11/dir12/dir13/dir14/dir15/dir16，它将将该文件重命名为 ，dir11_dir12_dir13_dir14_dir15_dir16_Analysis.mzXML 而不是dir11_dir12_dir13_dir14_dir15.mzXML.
  • 如果尝试将文件移动到已存在的名称，则会要求确认-i。mv
  • 应该--保护您免受以下开头的争论-。这不应该是问题，因为$arg应该始终以 开头./。
  • 如果您确实想从文件系统根目录执行此操作，那么应该可以。只需cd /按照上述说明操作即可。

事后思考：如果您有一个名为 的目录，这可能会失败Analysis.mzXML。所以不要这样做。

答案2

如果您仅使用 移动一个文件mv，则指定源文件名，然后指定目标文件名或者目标目录（如果您希望它在不同的目录中具有相同的名称）。例如

mv /path/to/Analysis.mzXML /new/directory/new-filename.mzXML

或（在新目录中保留相同的文件名）：

mv /path/to/Analysis.mzXML /new/directory/

如果您要移动多个文件，则目标必须是一个目录。例如

 mv /path/to/*.mzXML /new/directory/

如果您想复制一个或多个文件（使用cp而不是mv.

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