我有一个包含列出命令的文件：第一个是脚本名称，例如：get_1000g_r2_prevcf_snplist_e.pl，其他所有内容都是脚本的参数。这是主文件中的几行，我试图用它们来运行所有这些命令，例如 runscript：
get_1000g_r2_prevcf_snplist_e.pl 11:9554976-9657232 EUR ENSG00000133789.txt
get_1000g_r2_prevcf_snplist_e.pl 11:70272382-70444560 EUR ENSG00000131626.txt
get_1000g_r2_prevcf_snplist_e.pl 11:94324686-94541163 EUR ENSG00000020922.txt
...
我在做：
chmod u+x runscript
sh runscript
我正进入（状态：
line 1: get_1000g_r2_prevcf_snplist_e.pl: command not found
为什么会这样？所有内容都位于当前目录中。路径没有问题。
我确实做了：
export PATH=$PATH:.
运行后：
get_1000g_r2_prevcf_snplist_e.pl 11:9554976-9657232 EUR ENSG00000133789.txt
我有：
-bash: ./get_1000g_r2_prevcf_snplist_e.pl: Permission denied
答案1
get_1000g_r2_prevcf_snplist_e.pl是文件名，不是命令。
您的脚本是用 Perl 编写的，因此请runscript按照以下方式更改您的文件：
perl get_1000g_r2_prevcf_snplist_e.pl 11:9554976-9657232 EUR ENSG00000133789.txt
perl get_1000g_r2_prevcf_snplist_e.pl 11:70272382-70444560 EUR ENSG00000131626.txt
perl get_1000g_r2_prevcf_snplist_e.pl 11:94324686-94541163 EUR ENSG00000020922.txt
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