我有一个很长的文件(仅显示一部分):
145 27262253 2093226 747883433 76303046 2.74331
146 27992017 2188217 747883433 76303046 2.8678
147 30385435 2433407 747883433 76303046 3.18913
148 31218703 2514902 747883433 76303046 3.29594
149 33852828 2660530 747883433 76303046 3.48679
150 36161756 2836045 747883433 76303046 3.71682
Alignments 747883433 76303046
Bases 111613795461 11392665612
1 40000373 2754292 838333186 82982133 3.31914
2 35955786 2451917 838333186 82982133 2.95475
3 33056935 2241392 838333186 82982133 2.70105
4 32241895 2172229 838333186 82982133 2.61771
145 29490370 2184347 838333186 82982133 2.63231
146 30252912 2282821 838333186 82982133 2.75098
147 32862262 2544600 838333186 82982133 3.06644
148 33769718 2631164 838333186 82982133 3.17076
149 36673113 2787718 838333186 82982133 3.35942
150 39222287 2975755 838333186 82982133 3.58602
Alignments 838333186 82982133
Bases 125129342261 12391027833
1 35736929 2509527 741319423 80995147 3.09837
2 32185143 2238927 741319423 80995147 2.76427
3 29595482 2043259 741319423 80995147 2.52269
4 28861157 1978254 741319423 80995147 2.44244
我想匹配空行前 Alignments
词和词本身。期待:
Alignments 747883433 76303046
Alignments 838333186 82982133
是否可以?我还有很多其他的空白行和Alignments
单词。我的尝试:| awk '{if($1 ~ /^[[:space:]]*Alignments/) {print $0}}'
.但是,我得到:
Alignments 747883433 76303046
Alignments 838333186 82982133
答案1
$ awk '/^$|^Alignments/' input.txt | uniq
Alignments 747883433 76303046
Alignments 838333186 82982133
确保uniq
不会超过一任何行之前、之后或之间的空白行Alignments
。
grep
可以用来代替。或者sed -n
。或者perl -n
。例如
$ grep -E '^$|Alignments' input.txt | uniq
答案2
为什么我们不使用 grep 呢? :
grep -A1 "^$" file | grep -B1 'Alignments' | grep -v -- "^--$"
答案3
使用 GNU awk:
awk -v RS='\nAlignments[ 0-9]*' '{print RT}' file
记录分隔符RS
设置为预期的匹配,并使用RT
(记录终止符)为每个记录打印。
答案4
Sed 在此类任务中表现出色。首先,如果当前为空,我们将下一行粘贴到当前行。然后在满足设定的标准后询问并打印。
$ sed -ne '
/./!N
/^\nAlignments/p
' file.txt