如何从一个文件中提取包含另一个文件中的单词列表的行？

Question 1

grep -f file1 file2应该搜索file2所有模式file1并打印匹配的行。（不过，如果在任何地方都匹配，那么如果蛋白质名称以某种方式出现在第一列之后，这可能会产生误报。）由于您想要匹配固定字符串，您还可以添加-F.

Answer

grep -f file1 file2应该搜索file2所有模式file1并打印匹配的行。（不过，如果在任何地方都匹配，那么如果蛋白质名称以某种方式出现在第一列之后，这可能会产生误报。）由于您想要匹配固定字符串，您还可以添加-F.

Question 2

解决此问题的一种方法是转义 file1 中的所有正则表达式字符，并在下一步中从两端限制字符串。请注意，步骤的顺序是重要的。

这可以称为一种hybrid regex方法，其中要匹配的实际字符串将其所有正则表达式 BRE 字符转义，以便它成为文字字符串，同时在外围我们放置正则表达式字符以将匹配限制为第一个字段。

$ < file1 \
    sed -e '
      s:[[\.*^$]:\\&:g
      s/.*/^&[[:blank:]]/
'  | grep -f - file2

*Step-1 => 使用 BRE 表达式将 file1 中的字符串呈现为与 grep 相对应的纯字符串。

*Step-2 => 将上述转义字符串左侧限制为行首，右侧限制为空白字符。

Answer

解决此问题的一种方法是转义 file1 中的所有正则表达式字符，并在下一步中从两端限制字符串。请注意，步骤的顺序是重要的。

这可以称为一种hybrid regex方法，其中要匹配的实际字符串将其所有正则表达式 BRE 字符转义，以便它成为文字字符串，同时在外围我们放置正则表达式字符以将匹配限制为第一个字段。

$ < file1 \
    sed -e '
      s:[[\.*^$]:\\&:g
      s/.*/^&[[:blank:]]/
'  | grep -f - file2

*Step-1 => 使用 BRE 表达式将 file1 中的字符串呈现为与 grep 相对应的纯字符串。

*Step-2 => 将上述转义字符串左侧限制为行首，右侧限制为空白字符。

Question 3

您可以使用下面的 awk 命令

awk 'NR==FNR{a[$1];next}($1 in a){print $0}' file1 file2

Answer

您可以使用下面的 awk 命令

awk 'NR==FNR{a[$1];next}($1 in a){print $0}' file1 file2

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