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使用名称电子表格将许多文件的部分名称更改为唯一名称

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使用名称电子表格将许多文件的部分名称更改为唯一名称

我需要一些帮助。我想使用 bash 重命名许多具有唯一文件名的文件。我想保留原始文件名的一部分。

例如：

当前文件名 新文件名
F1.R23.fastq.gz 10_1.F1.R23.fastq.gz
F2.R7.fastq.gz 空_3_1.F2.R7.fastq.gz
F32.R3.fastq.gz 63_3.F32.R3.fastq.gz
F5.R7.fastq.gz 空白_3.F5.R7.fastq.gz
F2.R2.fastq.gz N5_1.F2.R2.fastq.gz

我所拥有的是一个文件，其中包含带有原始名称的列，以及包含我要添加到名称中的内容的列。就像这样：

文件 样本
F1.R23.fastq.gz 10_1
F2.R7.fastq.gz 空_3_1
F32.R3.fastq.gz 63_3
F5.R7.fastq.gz 空白_3
F2.R2.fastq.gz N5_1

如果有人有办法做到这一点，我将非常感激。我可能有数千个文件需要重命名，其中一些文件的名称很复杂并且顺序是随机的，因此手动执行此操作实际上不太可行。

谢谢你！

答案1

首先，创建一个名为 的 csv 文件files-to-rename.csv，或将您的电子表格转换为 CSV 格式。文件的内容应该是这样的：

F1.R23.fastq.gz,10_1
F2.R7.fastq.gz,empty_3_1
F32.R3.fastq.gz,63_3
F5.R7.fastq.gz,Blank_3
F2.R2.fastq.gz,N5_1

然后运行此命令，确保您与文件位于同一目录中：

while IFS=$',\r' read -r source dest ; do
  mv -v "$source" "${dest}.${source}"
done < files-to-rename.csv

如果 csv 文件具有 DOS 行结尾，则上述方法将不起作用。您可以使用该dos2unix files-to-rename.csv命令来确保文件以 UNIX 行结尾。

否则，请使用下面这个更安全的代码片段：

while read line; do
  source=$(echo $line | cut -d, -f1)
  dest=$(echo $line | cut -d, -f2)

  mv -v "$source" "${dest}.${source}"
done < files-to-rename.csv

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