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尝试删除后缀，但只能删除扩展名

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尝试删除后缀，但只能删除扩展名

我的文件格式为：

first_filename_R1_001.fastq.gz
first_filename_R2_001.fastq.gz
second_filename_R1_001.fastq.gz
second_filename_R2_001.fastq.gz
etc

我正在尝试在脚本中将每个组的 R1 和 R2 版本配对在一起。然而，我在删除后缀时遇到了困难。

for i in /directory/*_R1_*;do
echo "$i"
j=${i%"$R1_001.fastq.gz"}"R2_001.fastq.gz"
echo "$j"
done

我想得到什么：

/directory/first_filename_R1_001.fastq.gz
/directory/first_filename_R2_001.fastq.gz
...

我实际得到的是：

/directory/first_filename_R1_001.fastq.gz
/directory/first_filename_R1_001R2_001.fastq.gz
...

似乎由于某种原因仅删除了扩展名。有人可以帮我吗？

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