如何操作和提取表中的某些数据？

Question

我对 Linux 还很陌生。我有如下数据，它是 tbl 格式

>Feature gnl|XXX|IFEJKLFI_79
            locus_tag   IFEJKLFI_05549
            locus_tag   IFEJKLFI_05549
            protein_id  gnl|XXX|IFEJKLFI_05549

>Feature gnl|XXX|IFEJKLFI_88
            locus_tag   IFEJKLFI_05553
            locus_tag   IFEJKLFI_05553
            protein_id  gnl|XXX|IFEJKLFI_05553

我想提取 locus_tag 名称并将其与特征名称匹配。更详细地说，我希望输出看起来像这样

Feature gnl|XXX|IFEJKLFI_79     IFEJKLFI_05549
Feature gnl|XXX|IFEJKLFI_88     IFEJKLFI_05553

是否可以直接使用 awk 命令还是应该先操作数据？如果是，如何提取数据？

谢谢！！

Answer 1

如果每个数据块之间确实有空行，请使用任何 awk，如示例输入所示：

$ awk -v RS= '{print $1, $2, $4}' file
>Feature gnl|XXX|IFEJKLFI_79 IFEJKLFI_05549
>Feature gnl|XXX|IFEJKLFI_88 IFEJKLFI_05553

或者如果 locus_tag 行始终紧接在特征行之后，如示例输入所示：

$ awk '/^>/{feat=$0; n=0} ++n==2{print feat, $2}' file
>Feature gnl|XXX|IFEJKLFI_79 IFEJKLFI_05549
>Feature gnl|XXX|IFEJKLFI_88 IFEJKLFI_05553

或者这样：

$ awk '/^>/{feat=$0; f=1} f && $1=="locus_tag"{print feat, $2; f=0}' file
>Feature gnl|XXX|IFEJKLFI_79 IFEJKLFI_05549
>Feature gnl|XXX|IFEJKLFI_88 IFEJKLFI_05553