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化学分子结构绘图程序

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化学分子结构绘图程序

我正在寻找化学分子绘图包。

有化学工程它基本上建立了一个包含外部生成的分子结构的结构。

还化学图，这是最接近用户友好的解决方案，并使用前列腺素。

绝大多数化学家会使用伊斯兰国绘图或其他程序，其优点是能够根据 IUPAC 规则命名结构。还有 Brookhaven Protein 数据库，它具有大型蛋白质的文件格式。

我的问题是：是否有任何软件包可以将 ISISDraw（或类似的分子绘图软件包）文件格式转换为 pgf，或者是否有任何软件包比 Chemfig 更接近 ISISDraw

答案1

目前，答案是“否”。以下产品伊斯兰国绘图/加速抽奖或者化学绘图生成二进制文件，TeX 无法直接读取这些文件。因此，任何转换都需要单独的工具或读取文本文件格式，例如 ChemDraw 的 XML 格式。

目前最流行的期刊投稿文件格式是 ChemDraw.cdx格式，公开记录。因此，创建转换工具最明智的方法可能是读取.cdx文件。

答案2

现在这不是问题，因为我们有mol2chemfig，这是一个将化学结构从 smiles 格式或 MDL molfile 格式转换为 LaTeX 源代码的程序。然后可以使用出色且高度可定制的 chemfig LaTeX 包处理生成的代码。

mol2chemfig 文档在此处

该包可以在 CTAN 中找到： https://ctan.org/pkg/mol2chemfig

的主页mol2chemfig在这里（但目前处于离线状态）： mol2chemfig 主页

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