下面提供了我自己的答案，但您也可以随意添加自己的改进。
\utilde包中的命令在undertilde.sty重音符号和核心之间放置不同量的垂直空间，具体取决于方程式是否在单行环境中排版，（IE、内联数学、equation或displaymath）或多行环境（IE，，，，及其align相关环境）。gathermultline*-ed
在单行环境中，重音符号被给予适当的空间，但是在多行环境中，重音符号太远了。
下面是一个例子：
答案1
我回答我自己，因为我花了一段时间才发现这个问题的原因，而且我认为这对其他人有用。
这是软件包中的一个bug undertilde.sty，解释如下：
*TeX 中的垂直间距由两个粘连和一个维度控制：\baselineskip、\lineskip和\lineskiplimit。
\baselineskip控制从一行的基线到下一行的基线的距离——简单地说，就是从下到下的距离。如果此值相对于排版文本足够小，则行与行之间可能会发生冲突。为了避免这种情况，还监视从上一行的底部到下一行的顶部的距离，如果所需的值\baselineskip导致此从下到上的距离小于\lineskiplimit，则将\lineskip替换为粘连，从而提供绝对的从下到上的行间分离。
命令\utilde通过创建一个与核宽度相同的空框undertilde.sty来创建重音，然后将核和重音空框堆叠在一个命令中。为了实现适当的间距，该包包含以下行：\widetilde\vtop
\baselineskip=1pt\relax
这会缩小重音符和核心之间的间距。但是，此设置会导致行彼此重叠，因此此时\lineskip将改为设置。在单行环境中，我们有\lineskiplimit=0pt和\lineskip=1pt，这给出了适当的间距。但是，默认情况下，多行环境中有 和\lineskiplimit=3pt。\lineskip=4pt这意味着波浪号与核心之间的距离在多行环境中比在单行环境中多 1/24 英寸。
解决这个问题的方法是更新文件undertilde.sty，将上述行替换为以下内容：
\baselineskip=\z@\relax
\lineskiplimit=\z@\relax
\lineskip=1pt\relax
这将为所有数学环境设置适当的距离。