如何用 chemfig 绘制 Corrin 环？

Question

通过对卟啉示例的修改，我得到：

\documentclass[]{article}
\usepackage{chemfig}

\begin{document}
\chemfig{
    a-?[a]=[::+63]*5(
    -N?[b]=(
    -(-[::63]d)=[::-54]*5(
    -N?[c]-(
    =(-[::63]g)-[::-54]*5(
    -N?[d]-(
    -[:180]*5([]
    -N%(-[::-54,1.5]Fe?[b,,dotted]?[c]?[d,,dotted])
    -[,,1]?[a]=-=
    )
    )
    =-=
    )
    )
    -=-
    )
    )
    -=-
    )
}
\end{document}

下面显示的是我想要的，旋转了 90 度。请注意，我的问题是键长和第四环的角度。我应该能够自己更改 NH 或双键等细微差异。

Answer 1

让我们一步一步来。我们也像图中一样画出来。我们可以稍后旋转它。记住这一点，我们将只使用键的相对角度，即我们将使用符号::<angle>。

首先，我们需要确定分子的基线应该在哪里，因为这决定了我们需要从哪里开始编码分子。假设基线应该是分子的垂直中心。所以我们从右侧中间开始：

\chemfig{-[::120]*5(----N=)}

让我们添加下一个环：

\chemfig{-[::120]*5(---(=^-[::48]*5(----N=))-N=)}

?让我们在想要它与下部连接的地方添加钩子。

\chemfig{-[::120]*5(---(=^-[::48]*5(---?-N=))-N=)}

现在对于下部 - 由于我们将从头开始，我们将其编码为一个分支，即在里面()：

\chemfig{
  (=_[::-120]*5(-N=---))
  -[::120]*5(---(=^-[::48]*5(---?-N=))-N=)
}

最后一环：

\chemfig{
  (=_[::-120]*5(-N=(-=_[::-48]*5(-[,,,1]NH----))---))
  -[::120]*5(---(=^-[::48]*5(---?-N=))-N=)
}

请注意-[,,,1]NH，我们之前对债券使用了“到达”选项，NH因此它“到达”N而不是H。

最后一块：连接到第一个钩子的第二个钩子：

\chemfig{
  (=_[::-120]*5(-N=(-=_[::-48]*5(-[,,,1]NH-?---))---))
  -[::120]*5(---(=^-[::48]*5(---?-N=))-N=)
}

通过在分子开头添加[:90]或 ，可以轻松旋转 90 度。两种变化都需要在基团处进行调整：[:-90]NH

• [:90]：-[,,,2]HN-[,,2]
• [:-90]：-[,,,1]NH-[,,1]

完整代码：

\documentclass{article}
\usepackage{chemfig}

\begin{document}

\chemfig{
  [:90](=_[::-120]*5(-N=(-=_[::-48]*5(-[,,,2]HN-[,,2]?---))---))
  -[::120]*5(---(=^-[::48]*5(---?-N=))-N=)
}

\bigskip

\chemfig{
  [:-90](=_[::-120]*5(-N=(-=_[::-48]*5(-[,,,1]NH-[,,1]?---))---))
  -[::120]*5(---(=^-[::48]*5(---?-N=))-N=)
}

\end{document}

---

您稍后可以随时调整角度或其他细节：

\chemfig{
  [:90](=_[::-117]*5(-N=(-=_[::-54]*5(-[,,,2]HN-[,,2]?---))---))
  -[::117]*5(---(=^-[::54]*5(---?-N=))-N=)
}