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usr/bin/xterm Xt 错误：无法打开显示：/usr/bin/xterm：未设置显示？

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usr/bin/xterm Xt 错误：无法打开显示：/usr/bin/xterm：未设置显示？

我正在尝试通过以下方式向学校服务器（HPC）提交作业：

#!/bin/bash

#$ -S /bin/bash
#$ -cwd
#$ -o ./out_$JOB_ID.txt
#$ -e ./err_$JOB_ID.txt
#$ -notify

#$ -pe orte 1

date
pwd

##################################
RESULT_DIR=~/Results
SCRIPT_FILE=sample_job
##################################

. /etc/profile
. /etc/bashrc

module load packages/comsol/4.4
module load packages/matlab/r2012b

comsol server matlab "sample_job, exit" -nodesktop -mlnosplash

/bin/uname -a

mkdir $RESULT_DIR/$name
cp *.csv $RESULT_DIR/$name

作业中止说：

Sun Jun  8 14:20:21 EDT 2014
COMSOL 4.4 (Build: 150) started listening on port 2036
Use the console command 'close' to exit the program
/usr/bin/xterm Xt error: Can't open display: 
/usr/bin/xterm:  DISPLAY is not set
Program_did_not_exit_normally
Exception:
    com.comsol.util.exceptions.FlException: Program did not exit normally
Messages:
    Program did not exit normally

Stack trace:
    at com.comsol.mli.application.a.a(Unknown Source)
    at com.comsol.mli.application.MatlabApplication.doStart(Unknown Source)
    at com.comsol.util.application.ComsolApplication.doStart(Unknown Source)
    at com.comsol.util.application.ComsolApplication.doRun(Unknown Source)
    at com.comsol.bridge.Bridge$2.run(Unknown Source)
    at java.lang.Thread.run(Unknown Source)

ERROR: Could not start COMSOL Application. See log file: /home/.comsol/v44/logs/server2.log
java.lang.IllegalStateException: Shutdown in progress
    at java.lang.ApplicationShutdownHooks.add(Unknown Source)
    at java.lang.Runtime.addShutdownHook(Unknown Source)
    at org.apache.catalina.startup.Catalina.start(Catalina.java:699)
    at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
    at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source)
    at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source)
    at java.lang.reflect.Method.invoke(Unknown Source)
    at org.apache.catalina.startup.Bootstrap.start(Bootstrap.java:322)
    at org.apache.catalina.startup.Bootstrap.main(Bootstrap.java:451)
    at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
    at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source)
    at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source)
    at java.lang.reflect.Method.invoke(Unknown Source)
    at com.comsol.util.application.ServerApplication.a(Unknown Source)
    at com.comsol.util.application.ServerApplication.a(Unknown Source)
    at com.comsol.util.application.ServerApplication.a(Unknown Source)
    at com.comsol.util.application.ServerApplication.main(Unknown Source)

可能是什么原因以及我应该如何解决它？

答案1

我假设您在提交此脚本运行时使用 GridEngine 作为集群软件。像这样的东西：

$ qsub myscript.sh

您可以将环境变量包含到qsub您希望在 HPC 集群节点上生成的结果 shell 中，如下所示：

$ qsub -v DISPLAY=$(hostname):0.0 myscript.sh

这应该将您正在提交的系统的主机名“注入”为您希望远程显示任何 GUI 的系统。

您可能还需要执行此操作以允许本地系统“接收”此远程显示的窗口。最简单也是最不安全的方法是这样的：

$ xhost +

如果这有效并且您担心使其“更安全”，您可以更明确地表示，xhost +但这可能没有必要。让我们知道您的想法，如果需要，我们可以进一步调整。

如果上面的方法不起作用怎么办？

现在的较新版本qsub包含一个开关，-X据称可以$DISPLAY正确传递环境变量，如下所示：

$ qsub -X myscript.sh

您还可以尝试使用提交主机的 IP 地址而不是主机名。可能是 HPC 节点没有正确设置 DNS。

$ qsub -v DISPLAY="$(hostname -i):0.0" myscript.sh

参考

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