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ggplot PDF 图像的部分内容消失

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ggplot PDF 图像的部分内容消失

我正在使用tufte-bookdocumentclass 和模板。我一直将ggplot2图像导出为 PDF 格式，然后在figure环境中将它们包含在 LaTeX 中。

一切都很顺利，直到有一天，图表中的一些点突然消失了。它们在文档的先前版本中是存在的。具体来说，点形状 16 位于ggplot2（默认形状geom_point）不再显示。其他形状显示正常。我尝试重新安装ggplot2，试图摆脱tufte-book（如 reprex 中所示），没有成功。我也尝试过使用 xelatex 和 pdflatex 进行构建。这更加令人困惑，因为它用过的运行正常，我想不出我还可以做哪些更改。任何建议都将不胜感激。

作为参考，这是实际的ggplot2- 生成的 PDF 包括：

实际图像

以下是它在我的 LaTeX 文档中的显示方式（在 tufte-latex 版本中，尽管该问题也出现在 reprex 中的 documentclass{article} 版本中）：

LaTeX 中的图像

这是代码。我认为我在这里没有做任何不寻常的事情：

生成图表：

library(tidyverse)

# Police and crime
library(wooldridge)
data(crime4)

ggplot(crime4, aes(x = polpc, y = crmrte)) + 
  geom_point() + 
  theme_minimal() + 
  scale_x_log10() + 
  scale_y_log10() + 
  labs(x = "Police per Capita (log scale)",
       y = "Crime Rate (log scale)")
ggsave('crime1.pdf', width = 6, height = 5)

LaTeX 文档本身

\documentclass{article}

\usepackage{graphicx}

\begin{document}

\begin{figure}[h!]
    \caption{Police Presence and Crime Rate by County, North Carolina 1981-1987}
    \label{fig:causaldiagrams-crime1}
    \includegraphics{"crime1.pdf"}
\end{figure}

\end{document}

答案1

抱歉，我无法评论，所以我必须回答：当您从另一个 pdf 查看器打开编译后的文档时，预览中的点是否丢失？我遇到了同样的问题，这些点只在内置的 TeXmaker pdf 查看器中丢失，在其他程序中没有丢失……在我的情况下，R 中生成的所有圆形点（{16, 19, 20, 21} 中的 pch）都丢失了，但似乎只是pdf 查看器的一个问题（即它能理解的符号）。尝试使用正确显示绘图 pdf 的同一 pdf 查看器打开您编译的完整文档。如果它有效，则始终是 pdf 查看器。

此外，请注意，“相同”的 PDF 查看器可能会因操作系统的不同而有不同的表现。我最初以为是操作系统的问题，因为 TeXmaker 在 Linux 下显示点，但在 Windows 下不显示。所以我做了两次“同样的事情”，但结果不同。

我想这就像 Marijin 提到的一个问题，R 使用的圆圈符号无法正确显示。您可以使用建议的cairo_pdf设备代替 pdf，或者使用其他符号代替圆圈。您也可以尝试

geom_text(label = "\u2022", size = 10)

（可能需要包Unicode（？））。绘制文本而不是点，您可以尝试不同的符号或字符系列。

更新：我还发现，将点的不透明度设置为不同于 1 的值（例如，在 ggplot 中只需设置alpha=0.99）将阻止 R 使用“有问题的” ZapfDingbats 字符。可能值得一试，它似乎对我有用。

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