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如何编写 sed 单行命令以在每第三个字符后添加一个字符？

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如何编写 sed 单行命令以在每第三个字符后添加一个字符？

所以，我有一个看起来像这样的字符串：

AUGGCCAUGGCGCCCAGAACUGAGAUCAAUAGUACCCGUAUUAACGGGUGA

我想将字符串分割成由“+”号分隔的 3 个字符的块。

AUG+GCC+AUG+GCG+CCC+AGA+ACU+GAG+AUC+AAU+AGU+ACC+CGU+AUU+AAC+GGG+UGA

我想和我的好朋友一起这样做sed。

我试过

cat codons | sed -r 's/([A-Z]\{3\})/\1\+/g'

...没有成功。

sed我可以使用什么命令？

答案1

由于您不想要尾随+，因此您可以这样做：

fold -w3 | paste -sd+ -

也就是说，字符idthfold上的行，以及以精灵作为分隔符的那 3 个字符行，实际上就像将除最后一个换行符之外的每个换行符更改为.如果输入有多于一行，您最终会得到这些行与 a 的连接，这可能是也可能不是您想要的。3wpastes+d++

如果您确实需要它sed，您可以删除后面的尾随+：

sed 's/.../&+/g;s/+$//'

答案2

sed 's/.../&+/g'

为了让你的方式工作，你不需要转义{}符号：

sed -r 's/([A-Z]{3})/\1+/g'

答案3

这可能对你有用（GNU sed）：

sed 's/...\B/&+/g' file

答案4

如果 sed 不是必须的，那么使用 Ruby 可能是一种替代方案。 Ruby 解释器ruby可以像 sed 和 awk 一样使用，-n方法是使用使其迭代其输入的选项来运行它。然后，可以通过将 Ruby 单行代码添加为选项的参数-e（告诉解释器解释 的参数，-e而不是在文件中查找脚本）来向解释器提供 Ruby 单行代码。

对于这个特殊问题，您可以使用以下单行代码（改编自https://stackoverflow.com/a/3184271/789593）：

ruby -ne 'puts $_.scan(/.{3}|.+/).join("+")'

用通俗的语言来说就是

  • scan(/.{3}|.+/)匹配输入字符串中的任意 3 个字符或至少一个字符 , $_（在这种情况下，输入预计来自标准输入）并将每个匹配项放入一个数组中，
  • 将数组连接成一个字符串，并用“+”连接每个元素join("+")，,
  • 并打印以换行符结尾的内容puts。

例如

echo "AUGGCCAUGGCGCCCAGAACUGAGAUCAAUAGUACCCGUAUUAACGGGUG" | ruby -ne 'puts $_.scan(/.{3}|.+/).join("+")'
AUG+GCC+AUG+GCG+CCC+AGA+ACU+GAG+AUC+AAU+AGU+ACC+CGU+AUU+AAC+GGG+UG

请注意，它不会添加任何尾随“+”。

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