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使用 Unix 和 Awk 根据一列对文件进行排序

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使用 Unix 和 Awk 根据一列对文件进行排序

我需要根据第六列（即分数）对输入文件进行排序。

输入文件：

Sc2/80  20 . A T 86 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/80  20 . A C 80 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/60  55 . G T 90 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/60  55 . G C 99 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/20  39 . C T 97 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/20  39 . C A 99 Pass N=2 F=5;U=4

预期输出：

Sc2/20 39 . C T 97 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/20 39 . C A 99 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/60 55 . G T 90 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/60 55 . G C 99 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/80 20 . A T 86 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/80 20 . A C 80 Pass N=2 F=5;U=4

逻辑：对输入文件的所有偶数行进行比较，并根据分数（降序）进行排序，并打印文件中相应的奇数行。如果任何（偶数行）的分数相等，那么我们需要查看相应奇数行的分数，因此，较高的分数优先并首先打印。

答案1

一种可能的解决方案是将每两行放在一起，排序，然后再次拆分连接的行

awk '{ getline line; print $0, line }' input_file | 
    sort -k6,6nr -k15,15nr | 
    awk '{ $10 = "\n" $10; print }'

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