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Sun Grid Engine (6.2u5) 上的并行环境 (PE) 无法运行作业：“仅提供 0 个插槽”

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Sun Grid Engine (6.2u5) 上的并行环境 (PE) 无法运行作业：“仅提供 0 个插槽”

我在一台 8 核的 Ubuntu 10.10 服务器上安装了 Sun Grid Engine（版本 6.2u5）。为了能够预留多个插槽，我设置了一个并行环境 (PE)，如下所示：

pe_name            serial
slots              999
user_lists         NONE
xuser_lists        NONE
start_proc_args    /bin/true
stop_proc_args     /bin/true
allocation_rule    $pe_slots
control_slaves     FALSE
job_is_first_task  TRUE
urgency_slots      min
accounting_summary FALSE

这与相关服务器上的 all.q 相关（我们将其称为服务器 A）。但是，当我使用例如 qsub -q all.q@A -pe serial 4 mycmd.sh 提交使用 4 个线程的作业时，它从未被安排，我从 qstat 得到以下推理：

无法在 PE“串行”中运行，因为它仅提供 0 个插槽

为什么 SGE 说“串行”仅提供 0 个插槽，而我指定的服务器（服务器 A）上有 8 个可用插槽？

所讨论的队列配置如下（服务器名称已更改）：

qname                 all.q
hostlist              @allhosts
seq_no                0
load_thresholds       np_load_avg=1.75
suspend_thresholds    NONE
nsuspend              1
suspend_interval      00:05:00
priority              0
min_cpu_interval      00:05:00
processors            UNDEFINED
qtype                 BATCH INTERACTIVE
ckpt_list             NONE
pe_list               make orte serial
rerun                 FALSE
slots                 1,[D=32],[C=8], \
              [B=30],[A=8]
tmpdir                /tmp
shell                 /bin/sh
prolog                NONE
epilog                NONE
shell_start_mode      posix_compliant
starter_method        NONE
suspend_method        NONE
resume_method         NONE
terminate_method      NONE
notify                00:00:60
owner_list            NONE
user_lists            NONE
xuser_lists           NONE
subordinate_list      NONE
complex_values        NONE
projects              NONE
xprojects             NONE
calendar              NONE
initial_state         default
s_rt                  INFINITY
h_rt                  08:00:00
s_cpu                 INFINITY
h_cpu                 INFINITY
s_fsize               INFINITY
h_fsize               INFINITY
s_data                INFINITY
h_data                INFINITY
s_stack               INFINITY
h_stack               INFINITY
s_core                INFINITY
h_core                INFINITY
s_rss                 INFINITY
h_rss                 INFINITY
s_vmem                INFINITY
h_vmem                INFINITY,[A=30g], \
              [B=5g]

答案1

分配规则$pe_slots要求您提交的作业大小与任何一台机器上的核心数量完全相同。请将分配规则更改为$fill_up或尝试提交需要 8、30 或 32 个核心的作业。

答案2

qalter -w p我不知道答案，但您可以通过运行和来获取有关为什么网格引擎不调度作业的更多信息qalter -w v。唯一需要注意的是，至少在某些版本中，qalter -w v它不会像应该的那样忽略独占资源。

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