通过 yum 在 ec2 上将 R 升级到 3.1.1

通过 yum 在 ec2 上将 R 升级到 3.1.1

我有一个装有旧版本 (3.0.2) R 的 ec2 实例,我正在尝试将其更新到最新版本 (3.1.1)。这在默认 yum repo 中不可用,但在 EPEL 下可用。

安装的版本是3.0.2:

[hadoop@ip-172-31-19-15 ~]$ yum list R-core
Loaded plugins: priorities, update-motd, upgrade-helper
970 packages excluded due to repository priority protections
Installed Packages
R-core.x86_64                                                                                  3.0.2-1.17.amzn1                                                                                   @amzn-main
Available Packages
R-core.i686                                                                                    3.0.2-1.17.amzn1                                                                                   amzn-main

这些是 repos

[hadoop@ip-172-31-19-15 ~]$ yum repolist
Loaded plugins: priorities, update-motd, upgrade-helper
970 packages excluded due to repository priority protections
repo id                                                                             repo name                                                                                                     status
!amzn-main/latest                                                                   amzn-main-Base                                                                                                     4,801
!amzn-updates/latest                                                                amzn-updates-Base                                                                                                  1,497
epel/x86_64                                                                         Extra Packages for Enterprise Linux 6 - x86_64                                                                10,139+970
repolist: 16,437

指定 epel repo,我可以看到版本 3.1.1,它也被列出这里

sudo yum --disablerepo="*" --enablerepo="epel" list R-core
Loaded plugins: priorities, update-motd, upgrade-helper
Installed Packages
R-core.x86_64                                                                                  3.0.2-1.17.amzn1                                                                                   @amzn-main
Available Packages
R-core.i686                                                                                    3.1.1-3.el6                                                                                        epel      
R-core.x86_64                                                                                  3.1.1-3.el6   

但是,当我尝试使用安装时sudo yum --disablerepo="*" --enablerepo="epel" install R-core出现以下错误:

--> Finished Dependency Resolution
Error: Package: R-java-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: java-1.5.0-gcj
Error: Package: R-core-devel-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: libicu-devel
Error: Package: R-core-devel-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: tcl-devel
Error: Package: R-core-devel-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: tk-devel
Error: Package: R-core-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: libicuuc.so.42()(64bit)
Error: Package: R-core-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: xdg-utils
Error: Package: R-core-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: libicui18n.so.42()(64bit)
Error: Package: R-core-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: libtcl8.5.so()(64bit)
Error: Package: R-core-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: libtk8.5.so()(64bit)
 You could try using --skip-broken to work around the problem
 You could try running: rpm -Va --nofiles --nodigest

据推测这是由于禁用* repo 并且仅启用 epel 导致的,这可能会阻止找到某些依赖项,我不得不这样做,否则它只能从 amzn_main 中找到 3.0.2。

我应该使用什么正确的命令来从 epel repo 安装 3.1.1?

答案1

# yum install yum-priorities

需要为所有设置的存储库添加优先级。转到/etc/yum.repos.d编辑所有文件并添加优先事项

数字越低,重要性越高 —— 因此 EPEL 的数字最低。

例子:

[epel]
name=Extra Packages for Enterprise Linux 6 - $basearch
#baseurl=http://download.fedoraproject.org/pub/epel/6/$basearch
mirrorlist=https://mirrors.fedoraproject.org/metalink?repo=epel-6&arch=$basearch
failovermethod=priority
enabled=1
gpgcheck=1
gpgkey=file:///etc/pki/rpm-gpg/RPM-GPG-KEY-EPEL-6
priority=10

答案2

EPEL 与 Amazon Linux 不兼容。在早期,Amazon Linux 看起来更像 CentOS,但现在两者已经大不相同了。

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