我有一份大工作，我正在试验拓扑结构以查看什么可以产生更好的结果（使用ntasks、、等）我正在使用 slurm 作为我的工作队列管理器。ncores-per-cpunodes
我有两个节点（CentOS 7，使用 Bright 7 管理），每个节点都有 2xIntel(R) Xeon(R) CPU E5-2680 v3 @ 2.50GHz。因此，两个处理器有 12 个核心，全部超线程，所以我每个节点似乎有 48 个核心。（请参阅下面的处理器拓扑lstopo）
我的问题：我应该在 bios 中禁用超线程，还是尝试在 SLURM 中禁用它？或者只是将我的系统视为拥有双核？ 指定 --thread-per-core=1似乎没有效果。
我的工作是一个大型的环境模型，大量的 I/O，大量的矩阵计算等等，并且需要几天的时间才能运行。
我一直在读SLURM 常见问题解答，但仍然不清楚如何继续。
答案1
基本上，如果您觉得禁用 HT 后，您的操作将受益于更自由的 L2/L3 缓存，请继续从 BIOS 中禁用 HT。
然而，如果有大量的小型操作可以并行运行，那么启用 HT 肯定会对你有益。
http://lifehacker.com/how-hyper-threading-really-works-and-when-its-actuall-1394216262
答案2
Slurm 按核心分配，SLURM 的设计目标是可移植性而非性能。因此，其分配方式是“请注意，即使在启用了超线程的系统上，资源通常也会按核心级别分配给作业（请参阅下面的注释）。两个不同的作业不会共享一个核心。”。它确实知道什么是超线程，并且可以启用它，但它专门查看每个插槽的核心数。它是开源的，我相信超线程优化是有序的。