尝试让 qsub 在我的集群上运行

尝试让 qsub 在我的集群上运行

尝试让 qsub 在我的集群上运行(目前是单个节点,但会添加更多节点)到目前为止,尝试使用 qsub 提交失败

error: commlib error: got select error (Connection refused)

Unable to run job: unable to send message to qmaster using port 536 on host "nes.local": got send error.

Exiting.

我关注了 gridengine.org 上的一些帖子,建议:

/etc/init.d/sgemaster.nes start

/etc/init.d/sgeexecd.nes start

这似乎已经取得了进展,因为现在 qsub 说:

Your job 4 ("some_job.qsub") has been submitted

但它永远处于待定状态。

qhost -f返回:

HOSTNAME                ARCH         NCPU  LOAD  MEMTOT  MEMUSE  SWAPTO  SWAPUS
-------------------------------------------------------------------------------
global                  -               -     -       -       -       -       -
nes                     linux-x64      72  0.04  378.4G    6.4G   15.6G     0.0
   hl:arch=linux-x64
   hl:num_proc=72.000000
   hl:mem_total=378.413G
   hl:swap_total=15.625G
   hl:virtual_total=394.038G
   hl:load_avg=0.040000
   hl:load_short=0.080000
   hl:load_medium=0.040000
   hl:load_long=0.010000
   hl:mem_free=371.978G
   hl:swap_free=15.625G
   hl:virtual_free=387.603G
   hl:mem_used=6.435G
   hl:swap_used=0.000
   hl:virtual_used=6.435G
   hl:cpu=0.100000
   hl:m_topology=SCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTSCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT
   hl:m_topology_inuse=SCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTSCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT
   hl:m_socket=2.000000
   hl:m_core=36.000000
   hl:np_load_avg=0.000556
   hl:np_load_short=0.001111
   hl:np_load_medium=0.000556
   hl:np_load_long=0.000139

我将非常感激您的帮助,谢谢

答案1

如果我忘记在运行命令之前加载模块,就会出现该错误。

module load torque

(假设我们正在谈论扭矩。)这应该可以解决它:)或者把它放进去,.bashrc这样你就不必每次都输入它。

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