我有一个包含各种文件的路径的文件。
文件.txt:
/path/to/file1.txt
/path/to/file2.txt
...
/path/to/fileN.txt
我想在脚本中使用它来处理文件。
cat files.txt | xargs -P 12 -L 1 -I % /software/Linux/itt/idl/idl81/bin/idl -e program -args %
我基本上想通过 xargs 作为参数将这些路径作为字符串发送到这个 IDL 程序。
然而,当我使用cat时,它实际上cats file1.txt、file2.txt,并将它们的内容直接作为参数输出到这个IDL程序中。
我怎样才能让它将这个 files.txt 中的每一行作为字符串发送到这个 IDL 脚本?
答案1
您可以使用带有这样的循环的小脚本
随它去运行IDL.sh
#!/bin/ksh
while (read filepath)
do
/software/Linux/itt/idl/idl81/bin/idl -e program -args "$filepath"
done < "$1"
它简单、优雅,并且应该像魅力一样发挥作用。赶紧跑./runIDL 文件.txt就是这样!
答案2
GNU Parallel 可能适合您:
cat files.txt | parallel /software/Linux/itt/idl/idl81/bin/idl -e program -args {}
默认情况下,每个 CPU 核心有 1 个进程,并确保两个并行作业的输出不会混合。
GNU Parallel 是一个通用并行器,可以轻松地在同一台计算机或多台您可以通过 ssh 访问的计算机上并行运行作业。它通常可以代替for
循环。
如果您想要在 4 个 CPU 上运行 32 个不同的作业,则并行化的直接方法是在每个 CPU 上运行 8 个作业:
相反,GNU Parallel 在完成后会生成一个新进程 - 保持 CPU 处于活动状态,从而节省时间:
安装
如果您的发行版未打包 GNU Parallel,您可以进行个人安装,不需要 root 访问权限。这样做可以在 10 秒内完成:
(wget -O - pi.dk/3 || curl pi.dk/3/ || fetch -o - http://pi.dk/3) | bash
对于其他安装选项,请参阅http://git.savannah.gnu.org/cgit/parallel.git/tree/README
了解更多
查看更多示例:http://www.gnu.org/software/parallel/man.html
观看介绍视频:https://www.youtube.com/playlist?list=PL284C9FF2488BC6D1
浏览本教程:http://www.gnu.org/software/parallel/parallel_tutorial.html
注册电子邮件列表以获得支持:https://lists.gnu.org/mailman/listinfo/parallel