SLURM：自定义标准输出名称

Question 1

这是我从以前的答案中得出的结论

%j给出工作 ID
%x给出工作名称
我不知道如何以所需的格式获取日期。作业 ID 充当跨运行的唯一标识符，文件修改日期捕获日期以供以后分析。

我的 SBATCH 魔法如下所示：

#SBATCH --output=R-%x.%j.out
#SBATCH --error=R-%x.%j.err

我更喜欢添加R-作为前缀，这样我可以轻松移动或删除所有R-*

Answer

这是我从以前的答案中得出的结论

%j给出工作 ID
%x给出工作名称
我不知道如何以所需的格式获取日期。作业 ID 充当跨运行的唯一标识符，文件修改日期捕获日期以供以后分析。

我的 SBATCH 魔法如下所示：

#SBATCH --output=R-%x.%j.out
#SBATCH --error=R-%x.%j.err

我更喜欢添加R-作为前缀，这样我可以轻松移动或删除所有R-*

Question 2

你不能，至少不能按照你想要的方式去做。这些#SBATCH行是 shell 注释，恰好由sbatch命令解释，您不能在其中执行 shell 代码。

此外，sbatch的-o选项仅理解非常有限的一组替换符号（请参阅下面的手册页摘录）。

可能最接近您想要的结果是sbatch在包装器脚本中运行，该脚本将作业 ID、作业名称以及当前日期和时间附加到文本文件（例如timestamp<TAB>jobid<TAB>jobname）中，然后使用该脚本作业运行完成后重命名输出文件。

time_t，或“自纪元以来的秒数”，即date +%s，是脚本中最有用的日期/时间格式。它可以很容易地按照您想要的方式进行漂亮的打印，而无需先解析它。

squeue -t BF,CA,CD,F,NF,PR,TO编写一个脚本来遍历该文本文件并重命名每个不再运行的作业 ID（使用检查）并且还未重命名的输出文件并不困难。

仅供参考，手册页sbatch说：

-o，--输出=

指示 Slurm 将批处理脚本的标准输出直接连接到“文件名模式”中指定的文件名。默认情况下，标准输出和标准错误都定向到同一个文件。对于作业数组，默认文件名是slurm-%A_%a.out，由作业 ID 和数组索引%A替换。%a对于其他作业，默认文件名是slurm-%j.out，其中%j被作业 ID 替换。--input option有关文件名规范选项，请参阅。

而且，因为-i它说：

-i，--输入=

指示 Slurm 将批处理脚本的标准输入直接连接到“文件名模式”中指定的文件名。默认情况下，/dev/null在批处理脚本的标准输入上打开，标准输出和标准错误都定向到名为的文件slurm-%j.out，其中%j被替换为作业分配号，如下所述。

文件名模式可以包含一个或多个替换符号，这些替换符号是%百分号后跟一个字母（例如%j）。

支持的替换符号有：
%A Job array's master job allocation number.
%a Job array ID (index) number.
%j Job allocation number.
%N Node name. Only one file is created, so %N will be replaced
   by the name of the first node in the job, which is the one
   that runs the script.
%u User name.

Answer