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apt-get 安装、路径目录及运行依赖程序

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apt-get 安装、路径目录及运行依赖程序

我对 Ubuntu 还很陌生，如果我给出的解释过于外行，请多包涵。

我的操作系统：Ubuntu 11.10 服务器，64 位版本

我需要使用三个工具samtools，bowtie和tophat。但是tophat依赖于 samtools 和 bowtie。依赖因素是 - 确定上述两个工具（samtools 和 bowtie）的路径究竟位于何处。

现在，我可以使用sudo apt-get installhowever安装 samtools 和 bowtie

  • 我不知道 samtools 或 bowtie 的库路径具体在哪里
  • 根据 tophat 安装说明，我要从压缩文件中提取工具，将目录更改为此文件并执行 ./configure；但我在提取的目录中没有看到 ./configure 脚本

山姆工具和领结和高顶礼帽在他们的网站上找到，这是安装方法我正在尽力追随。

答案1

要找出库的安装位置，你可以尝试dpkg -L samtools对 bowtie 进行同样的操作

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