我正在运行orthomcl
使用 的程序mysql
。以前,该程序在同一台计算机上运行良好。这次我收到了错误消息。
DBD::mysql::st execute failed: Can't create/write to file '/tmp/#sql_700_1.MYI' (Errcode: 13) at /usr/local/bioinf/orthomclSoftware-v2.0.9/bin/orthomclPairs line 709, <F> line 14.
我试图重新启动mysql
服务器,服务器关闭但无法启动。
sudo service mysql start
start: Job failed to start
/var/log/mysql/error.log
和/var/log/mysql.err
都是空的。我尝试了在这里找到的一些方法,包括清除、重新安装mysql-server
和ib_logfile*
删除/var/lib/mysql
。
我尝试的另一件事是
sudo dpkg-reconfigure mysql-server-5.5
错误信息如下:
/usr/sbin/mysqld: Can't create/write to file '/tmp/ibNzqwO0' (Errcode: 13)
InnoDB: Error: unable to create temporary file; errno: 13
[ERROR] Plugin 'InnoDB' init function returned error.
[ERROR] Plugin 'InnoDB' registration as a STORAGE ENGINE failed.
[ERROR] Unknown/unsupported storage engine: InnoDB
[ERROR] Aborting
以下是一些信息dmesg | grep mysql
:
[3115187.338273] init: mysql main process (44255) terminated with status 1
[3115187.338417] init: mysql main process ended, respawning
[3115187.356361] init: mysql post-start process (44256) terminated with status 1
[3116827.473256] type=1400 audit(1396394069.224:132): apparmor="DENIED" operation="open" parent=45387 profile="/usr/sbin/mysqld" name="/home/tmp/" pid=45396 comm="mysqld" requested_mask="r" denied_mask="r" fsuid=0 ouid=0
[3116827.582489] type=1400 audit(1396394069.332:133): apparmor="DENIED" operation="mknod" parent=45387 profile="/usr/sbin/mysqld" name="/home/tmp/#sql_b154_0.MYI" pid=45402 comm="mysqld" requested_mask="c" denied_mask="c" fsuid=0 ouid=0
[3116827.908448] type=1400 audit(1396394069.660:134): apparmor="DENIED" operation="mknod" parent=45317 profile="/usr/sbin/mysqld" name="/home/tmp/ibbPfaqP" pid=45415 comm="mysqld" requested_mask="c" denied_mask="c" fsuid=118 ouid=118
[3116841.623608] type=1400 audit(1396394083.372:139): apparmor="STATUS" operation="profile_replace" name="/usr/sbin/mysqld" pid=45443 comm="apparmor_parser"
[3116841.771621] init: mysql pre-start process (45474) terminated with status 1
像这样的线条还有很多很多。
有人能帮我找出我的 MySQL 服务器出了什么问题吗?
非常感谢。
答案1
原因是您的/tmp
符号链接到另一个位置,/home/tmp
。但 MySQL 受到 AppArmor 的保护,不允许自由写入/home/tmp
。要补救这种情况,您可以编辑/etc/apparmor.d/abstractions/user-tmp
并在那里适当添加/home/tmp
;对我来说,额外的行
owner /home/tmp/** rwkl,
/home/tmp/ rw,
成功了。
答案2
听起来你对 的权限不够/tmp
,而 应该是所有人都可以写入的。你应该能够使用以下命令修复它:
sudo chmod 1777 /tmp
这会将权限设置为777
(所有人的 rwx),并设置建议用于目录的粘性位/tmp
。如中所述man chmod
:
限制删除标志或粘滞位
限制删除标志或粘性位是一个单独的位,其解释取决于文件类型。对于目录,它可以防止非特权用户删除或重命名目录中的文件,除非他们拥有该文件或目录;这称为目录的限制删除标志,通常位于 /tmp 等可全局写入的目录中。对于某些较旧系统上的常规文件,该位将程序的文本图像保存在交换设备上,以便在运行时加载速度更快;这称为粘性位。