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awk 获取具有最大字段的同一列

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awk 获取具有最大字段的同一列

我有两个文件。我必须从文件 1 中获取匹配的名称，打印文件 1 的全部内容，并使用具有最大值的第二个文件在文件 1 中添加第四列 (exp)

file1

name             value1          value2          value3
hat_197050       30.5348         37.2617         1.2203
hat_160460       20.8679         21.0134         1.00697
hat_092950       63.875          63.2321         0.989935

file2

hat_160460  AA:0003700,AA:0003707,AA:0005634,AA:0006355,AA:0043401 
hat_160460  AA:0003700,AA:0003707

期望的输出：

name             value1          value2          value3  exp
hat_197050       30.5348         37.2617         1.2203
hat_160460       20.8679         21.0134         1.00697 AA:0003700,AA:0003707,AA:0005634,AA:0006355,AA:0043401 
hat_092950       63.875          63.2321         0.989935

我想用awk.我写了这两个得到匹配的列，但它只给出了匹配的

awk 'FNR==NR{a[$1]=$0;next}{if(b=a[$1]){print }}' file1 file2 > matched
this command to get the file2 with max field
awk 'BEGIN { FS = "," } ;{if (NF > max) {max = NF ; line =$0}} END{print line}' file2

我不知道如何将两者结合起来以获得我想要的东西。任何建议的阅读将不胜感激。

答案1

awk '
    FNR == NR {
        # Read file1
        i=$1;
        sub($1 FS, "");
        a[i]=$0; next;
    }
    (FNR < NR) && (FNR == 1) {
        # add new column header to title row (first line of file1)
        print $0 "exp"; next;
    }
    { 
        # Read file2 and append matching line from file1
        print $0 a[$1];
    }
' file2 file1

请注意，在上面的解决方案中file2读取 before来file1提取要匹配的第一列（因此file2在 before 中指定file1）。此外，该解决方案将使用最后一场比赛in file2（在您的示例中，hat_160460在 中出现两次file2）。

结果：

file1 name value1 value2 value3 exp
hat_197050 30.5348 37.2617 1.2203 
hat_160460 20.8679 21.0134 1.00697 AA:0003700,AA:0003707
hat_092950 63.875 63.2321 0.989935

如果您想使用第一场比赛中file2，然后将FNR == NR上面的部分替换为

FNR == NR {
    # Read file1
    i=$1;
    sub($1 FS, "");
    if (! a[i]) a[i]=$0;
    next;
}

结果：

file1 name value1 value2 value3 exp
hat_197050 30.5348 37.2617 1.2203 
hat_160460 20.8679 21.0134 1.00697 AA:0003700,AA:0003707,AA:0005634,AA:0006355,AA:0043401 
hat_092950 63.875 63.2321 0.989935

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