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awk 打印所有匹配行，包括重复项

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awk 打印所有匹配行，包括重复项

如何打印两个文件之间的所有匹配行（包括重复项）

源文件：

SNP value
RS1 0.55
RS2 0.52
RS3 0.25
RS4 0.22

查询文件：

SNP
RS1
RS2
RS2
RS3
RS4
RS4

期望的输出：

SNP value
RS1 0.55
RS2 0.52
RS2 0.52
RS3 0.25
RS4 0.22
RS4 0.22

目前我正在使用以下命令来检索匹配的行，但正在删除重复项，而我需要打印包括重复项在内的所有行，

有什么建议请

谢谢

awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"}NR==FNR{a[$1]=$0;next}a[$1]{print}' queryfile sourcefile > output

答案1

该join命令将为您将这两个文件连接在一起

join sourcefile queryfile

输出（来自示例文件）

SNP value
RS1 0.55
RS2 0.52
RS2 0.52
RS3 0.25
RS4 0.22
RS4 0.22

答案2

本质上只是以相反的顺序处理文件的问题

$ awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"} NR==FNR{a[$1]=$0;next} a[$1]{print a[$1]}' sourcefile queryfile
SNP value
RS1 0.55
RS2 0.52
RS2 0.52
RS3 0.25
RS4 0.22
RS4 0.22

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