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无法为 R 安装 geojson 包

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无法为 R 安装 geojson 包

我有 Ubuntu 16.04 和 R 3.4.3。当我运行

install.packages("geojson", dep=TRUE)

在 R 中，我收到以下错误：

依赖项“protolite”不适用于包“geojson”

因此我跑

install.packages("protolite", dep=TRUE)

我得到：

Configuration failed because protobuf was not found. Try installing:
 * deb: libprotobuf-dev (Debian, Ubuntu, etc)
 * rpm: protobuf-devel (Fedora, EPEL)
 * csw: protobuf_dev (Solaris)
 * brew: protobuf (OSX)
If protobuf is already installed, check that 'pkg-config' is in your
PATH and PKG_CONFIG_PATH contains a protobuf.pc file. If pkg-config
is unavailable you can set INCLUDE_DIR and LIB_DIR manually via:
R CMD INSTALL --configure-vars='INCLUDE_DIR=... LIB_DIR=...'

然而，protoc --version在终端运行我得到

libprotoc 2.6.1

看来我安装了最新版本。我还尝试protobuf.pc复制/usr/lib/pkconfig/并PKG_CONFIG_PATH设置

export PKG_CONFIG_PATH=/usr/lib/pkgconfig

但没有成功。我不知道如何检查是否pkg-config在我的 中 PATH，也不知道如何遵循后面的手动说明。特别是，我不知道应该为INCLUDE_DIR=...和写入哪些目录LIB_DIR=...。

我该如何继续？

答案1

您可以使用下列操作安装 R 包

#1. add R 3.4.3 repository if not added before
cat <<EOF | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/r-cran.list
deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial/
EOF

sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E084DAB9

#2. add repository for libjq-dev
sudo add-apt-repository -y ppa:opencpu/jq

#3. update package lists
sudo apt-get update

#4. install R and dependencies
sudo apt-get install r-base-dev r-base-core libjq-dev libcurl4-openssl-dev \
libssl-dev libprotobuf-dev libjq-dev libv8-3.14-dev protobuf-compiler

#5. launch R and install geojson package:
R
> install.packages("geojson", dep=TRUE)

答案2

我刚刚发现我的/usr/bin/pkg-config（与 Ubuntu 18.04 捆绑的 0.29.1 版本）漏洞百出。它不会查看 PKG_CONFIG_PATH 中提到的目录（调试输出中未看到自定义目录）。我不得不从源代码构建较新的版本（0.29.2）。这解决了我的问题。

希望它能帮助别人

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