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变量捕获和 For 循环运算

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变量捕获和 For 循环运算

我的输入文件是行长度可变的单列。我的代码应该计算这些行，并打印指定的数字。我遇到的问题是，如果变量“A”中捕获的行数小于 1，我希望它至少打印 1 行，以便输出文件不为空。如果“A”（总行数的 1%）大于 1，我想打印该行数。我的混合 awk-bash 代码如下所示：

#!/bin/sh
for i in {1..2}
do
input="../ExpressionSet_"$i"_chunk.txt"
    for j in {1..2}
do

A=$(awk 'END{print NR*0.01}' $input)
Y=1
X=0
if (( "$A" -lt "$Y")); then
X=$A+1
else
X=$A

fi
awk 'NR<='$X' {print $0}' $input > "$i"_top1pc.txt

B=$(awk 'END{print NR*0.05}' $input) 
awk 'NR<='$B' {print $0}' $input > "$i"_top5pc.txt

令人困惑的是，我不断收到类似的错误消息

thresholdSelector_pc.sh: line 20: ((: 0.24 -lt 1: syntax error: invalid arithmetic operator (error token is ".24 -lt 1")
thresholdSelector_pc.sh: line 20: ((: 47.24 -lt 1: syntax error: invalid arithmetic operator (error token is ".24 -lt 1")

顺便说一句，inputFile1有24行，inputFile2有4724行。谢谢您的帮助！

答案1

我认为你的根本问题是你试图在 sh 脚本中使用 bash 语法。 Bash 定义了 sh 公分母的扩展；如果您想使用 bash 特定的功能，您的脚本必须以 开头#!/bin/bash，而不是#!/bin/sh。

Sh 没有((…))算术表达式的语法。但这里不需要它，您可以使用可移植的[ … ]条件语法。在[ … ]条件句中，写有“小于”运算符-lt。

大括号{1..2}是 sh 中不存在的另一个 bash 功能。脚本中的另一个错误是X=$A+1，它设置X为一个字符串，就像42+1if 的值A是42;要执行算术计算，您需要使用算术表达式语法$((…))。

另外，作为一般性评论，始终在变量替换周围使用双引号。

您的代码的另一个问题是它看起来像是A一个十进制数。 Shell 算术仅适用于整数。我已经调整了算法，但检查了它的作用，我可能没有按照您想要的方式进行舍入。仅使用 awk 来计算行数就有点过分了，wc -l这是一种更清晰、更快的方法。同样，要打印文件的前 N ​​行，只需调用head.

另一个错误是$i_chunk变量的值i_chunk。要获取i并追加的值_chunk，您需要用大括号分隔变量名称：${i}_chunk。

我不知道循环j应该做什么，我没有管它。

#!/bin/sh
for i in 1 2
do
  input="../ExpressionSet_${i}_chunk.txt"
  for j in 1 2
  do
    A=$(wc -l <"$input")
    Y=100
    X=0
    if [ "$A" -lt "$Y" ]; then
      X=$((A+100))
    else
      X=$A
    fi
    head -n "$((X/100))" "$input" > "$i"_top1pc.txt
    head -n "$((X/20))" "$input" > "$i"_top5pc.txt
  done
done

如果您选择编写 bash 脚本，则可以利用多个 bash 功能：

  • ((…))用于算术评估（但仍然仅限整数）
  • typeset -i声明一个整型变量，以便分配一个算术表达式来计算它
#!/bin/bash
for i in 1 2
do
  input="../ExpressionSet_${i}_chunk.txt"
  for j in 1 2
  do
    A=$(wc -l <"$input")
    Y=100
    typeset -i X
    if ((A < Y)); then
      X=A+100
    else
      X=$A
    fi
    head -n "$((X/100))" "$input" > "$i"_top1pc.txt
    head -n "$((X/20))" "$input" > "$i"_top5pc.txt
  done
done

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