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有没有办法突出显示发生错误的行部分

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有没有办法突出显示发生错误的行部分

我正在运行这个脚本并收到这样的错误，但我很难检测到错误到底发生在哪里。是否有一个选项可以准确指出导致错误的字符？

./ISCNhelperScripts/script.sh: line 34: syntax error near unexpected token `('
./ISCNhelperScripts/script.sh: line 34: `egrep -o "[)+,]dic\([1-2]?[0-9XY];[1-2]?[0-9XY]\)\([pq][0-9][0-9];[pq][0-9][0-9]\)" input | cut -c 2- |  tr '(' '\t' | tr ')' '\t' | tr ";" "\t" | awk 'BEGIN {OFS = "\t"} {print $2,$3,$4,$5}' > dicentrics'

答案1

拆分您的命令，以便错误消息中的行号会给您提示

egrep -o "[)+,]dic([1-2]?[0-9XY];[1-2]?[0-9XY])([pq][0-9][0-9];[pq][0-9][0-9])" input | \  
cut -c 2- | \
tr '(' '\t' | \ 
tr ')' '\t' | \  
tr ";" "\t" | \  
awk 'BEGIN {OFS = "\t"} {print $2,$3,$4,$5}' > dicentrics

看来您由于声明()中未转义大括号而遇到问题。egrep我首先在声明 中用反斜杠转义它们\和/或"用单引号替换双引号。'egrep

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