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按标头组合目录中的文件并省略共享内容

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按标头组合目录中的文件并省略共享内容

所以我在这里发现了一个与我想做的相反的问题：连接具有相同标头的多个文件。

我正在尝试根据标头中的“>”字符将 2 个文件（在具有相同子字符串的对应文件的目录内的数百个文件中）合并或连接到一个文件中。每个文件中有数千个标题，与我附加的链接中提出的问题相反，标题以外的内容是相同的，所以我不想更改任何内容，除了以“>”开头的每一行。

本质上，我想通过共享字符“>”将 file1 与 file2 组合起来，并按顺序保留文件 1 的内容。

File1
> MGBNCNOSNC_142
9u2o4840204a9
> MGBNCNOSNC_143
AOISCJNWDCSNDCCW
> MGBNCNOSNC_144
AOISCJ40204DZZW

File2
>King_Henry
>Queen_jerry
>Jack_jill

Output
> MGBNCNOSCNC_142 > King_henry
9u2o4840204a9
> MGBNCNOSCNC_143 > Queen_jerry
AOISCJNWDC
> MGBNCNOSNC_144 > Jack_jill
gefSCJ40204DZZW

感谢您的帮助，如果我能更清楚的话请告诉我！

答案1

您可以将行读File2入索引 awk 数组，然后依次将它们附加到File

awk '
  NR==FNR {a[i++]=$0; next} 
  /^>/ {$0 = $0" "a[j++];}
  {print}
  ' File2 File1

或者，如果您有 GNU sed （带有R扩展名），您可以尝试

sed '/^>/ R File2' File1 | sed '/^>/ {N;s/\n/ /}'

如果您的File1每一行都需要匹配一个附加行，则另一种选择可能是双倍空格File2，然后将paste文件放在一起

sed 'G' File2 | paste -d ' ' File1 -

尽管这会导致非匹配行中出现额外的尾随空格；如果这是不可取的，您可以在每File2行的开头插入一个空格，并且paste不带分隔符

sed 's/^/ /; G' File2 | paste -d '' File1 -

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