如何安装 VEP (Ensembl 变异效应预测器)？

Question

我正在尝试通过安装 VEP这个要点。我没有 conda，所以首先我尝试将其安装到$HOME/miniconda3如下位置：

curl -sL https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-py37_4.9.2-Linux-x86_64.sh -o /tmp/miniconda.sh
sh /tmp/miniconda.sh -bfp $HOME/miniconda3

运行上述命令后，出现此错误：

sh: 0: Can't open /tmp/miniconda.sh

如果您能帮助我解决问题，我将不胜感激！

Answer 1

简短回答你的问题：

尝试执行chmod +x /tmp/miniconda.sh然后重新运行sh /tmp/miniconda.sh -bfp $HOME/miniconda3

此命令使.sh可执行文件生效。然后重新运行命令。

下载并安装 miniconda 的另一种方法（与 conda 相同，但仅适用于命令行）：

.sh如果你想获得 miniconda，我建议从以下网址下载最新文件这里。

然后运行chmod +x downloadedfilename.sh

最后执行它：./downloadedfilename.sh。