操作系统版本： CentOS 版本 4.6（最终版）内核 \r 位于 \m 2.6.9-100.ELsmp 上 问题 当我运行 qdel 时出现以下错误： qdel: Unknown Job Id 20432.scyld.localdomain 信息 qstat -n 的输出： head0.localdomain：Req'd Req'd Elap 作业 ID 用户名 队列 作业名称 SessID NDS TSK 内存 时间 S 时间 20432.head0.localdom 用户名 标准 pc-iw-1 327...
操作系统版本：CentOS 版本 4.6（最终版）内核 \r 位于 \m 2.6.9-100.ELsmp 上 当我尝试运行一项作业时，它给出了如下错误。 qsub: Bad UID for job execution 我创建了一个新的用户帐户，并且出现了同样的错误，但同一台机器上的其他用户可以毫无问题地运行作业。 我该如何修复此问题？ ...
我正在管理一个 PBS/torque HPC 集群，现在我正在设置另一个集群斯拉普在 PBS 集群上，我可以设置一个队列，使其只接受交互式作业，qmgr -c "set queue interactive_q disallowed_types = batch"并使其只接受批处理作业qmgr -c "set queue cu disallowed_types = interactive"。 但是，浏览 SLURM 官方文档后，我没有找到与 SLURM 等效的设置。 如何在 SLURM 集群上设置分区以仅接受交互式或批处理作业？ ...
我想了解使用混合并行化 MPI/OpenMPI 的 PBS/Torque 在我的 SGI 集群上启动的 GROMACS 作业的工作原理。 该集群启用了超线程，每个节点有 16 个物理核心（32 个逻辑核心）。 我期望：使用 4 个节点和每个节点的所有可用 CPU（因此每个节点有 16 个物理 CPU 和 32 个线程，如果我没记错的话，总共有 64 个核心和 128 个线程）。 我做了一个测试工作，应该能满足我的期望。这些是我在 PBS 脚本中用于询问资源的行： ... #PBS -l select=4:ncpus=16:mpiprocs=16...
我们有一个执行不同任务的集群。它使用 Torque 调度程序计算模拟。我们还有一个交互式模拟，它也需要全部计算能力。交互式模拟是一个 OpenMPI 程序，在每个节点上启动进程。 因此，我们希望实现以下目标：如果启动了交互式模拟，则所有 pbs 作业都应转移到后台，从而释放交互式模拟的工作负载。 使用这两种不同的并行化方案是否可能实现这一点？ 我尝试了以下操作：我在 /etc/security/limits.conf 中附加了一行，为扭矩队列的用户分配了较低的优先级 user hard priority 10 对于每个节点上的每...
我有一个编译好的文件 a.out，直接从我的终端执行时运行良好。但是，尝试从我的 PBS 文件执行该文件时会出现缺少库的情况libmkl_intel_lp64.so。我已经尝试过 将库的路径导出到 LD_LIBARY_PATH 用于source a.out intel64链接我的 PBS 文件中的可执行文件 有什么建议么？ ...
如上所述，我刚刚在 Ubuntu 16.04 机器上安装了 Torque。提交的作业完成得很好，但-e和-o标志似乎不起作用。没有创建错误和日志文件，尽管我有 给标志一个日志目录的绝对路径。 提交作业之前在目录中创建日志文件。 我确信 PBS 文件可以正常工作，因为我是从一台可以正常运行该作业的机器上复制来的。 以下是提到的 PBS 文件。对于我无法缩进代码块，我提前表示歉意。 #! /bin/bash #PBS -e /path/to/error.err #PBS -o /path/to/log.log #PBS -l nodes=1:pp...
我已经成功在我的 ubuntu 服务器上安装了 Torque PBS。作业提交正常。然而有一件烦人的事情。我发现 PBS 中的 bash 环境不正确 例如 echo 'echo $PATH > ~/res.txt' | qsub res.txt 的内容是 /home/admin-pc/bin:/home/admin-pc/.local/bin:/bin:/usr/bin:/snap/bin 这绝对不是我的路径。 所以我尝试了 echo 'source ~/.bashrc;echo $PATH > ~/res.txt' | qsu...
我使用 Torque 来管理我拥有有限数量许可证（确切地说是 4 个）的软件。白天我需要保留 2 个许可证用于处理案件，晚上和周末我可以使用所有 4 个许可证来解决案件。有没有办法设置 Torque，使其在周一至周五早上 6 点到下午 6 点保留 2 个许可证，但在其他时间仍然使用所有 4 个许可证？ ...
我在 Redhat 7.1 上设置了一个小型计算集群。它运行 PBS 扭矩队列系统，版本为 5.1.1。 当我将多个作业排队时，它开始以“向后”优先级运行这些作业。它从最后提交的作业开始。 是否有任何设置可以改变这种行为，以便首先提交的作业首先启动？ ...
我在使用 Torque + Maui 时遇到了麻烦。 问题如下：我有 2 个队列，每个队列有 10 个关联节点。如果我向第一个队列提交 10k 个作业，向第二个队列提交 1 个作业，则第二个队列中的作业仍处于 Q 状态。 [root@localhost bin]# ./showstart 366808 job 366808 requires 2 procs for 1:00:50 Earliest start in 00:00:00 on Fri Dec 18 16:27:21 Earliest c...
我有一台配备 48 核 CPU + 4 个 NVIDIA GPU 的 GPU 工作站。我将把这台机器变成一个小型集群，其中包含： 4 个节点 12 核 +1 CPU/节点 我已经使用以下命令在这台机器上安装了 Torque： ./configure --without-tcl --enable-nvidia-gpus --prefix=/soft/torque-5.1.1 --with-nvml-include=/usr/local/cuda/gpukit/usr/include/nvidia/gdk -...
首先，我对集群和 PBS 系统非常陌生。我被要求准备一个简单的脚本（我照做了）： #PBS -S /bin/bash #PBS -o host_out #PBS -e host_err #PBS -q batch hostname date exit 0 然后，我使其可执行并使用以下命令提交： qsub job.sh 并获取了它的 ID（所以看起来作业已正确提交，对吗？）但我看不到任何答案，我的意思是，甚至文件都host_out没有host_err创建。可能出了什么问题？我还需要做什么才能提交作业？ ...
在我们的集群中安装了 PBS 批处理系统（torque），我们希望所有用户都通过 qsub 执行他们的作业，以便可以很好地管理 CPU 资源。但是，我们发现集群中的用户仍然可以直接在他们的 bash shell 中运行他们的程序。 我注意到其他一些集群系统限制用户运行自己的二进制文件。他们的命令提示符与完全特权的命令提示符不同。（从~>开始） qczhan2@barrine1:~>echo $0 -bash 在他们的配置中，用户可以运行基本命令，例如 ls、pwd、cp 和 cd，但是当我们运行自己的二进制文件时，系统会提醒“权限不允许”...