几天前我升级了 R（从 3.6 到 4.0）和 RStudio（从 1.1 到 1.2.5），昨天又将 Ubuntu 从 18.04 升级到了 20.04。
从那时起，R有时执行某些命令时永不终止：（ivreg来自包AER）、summary（逻辑回归）和logitmfx（来自包mfx）。有时这些命令运行良好，但大多数时候我必须终止进程（killall rstudio），因为 R 不会终止执行，即使按下 RStudio 中的红色停止按钮也是如此。
当我尝试时example('AER')，它工作正常。然后我重新安装了包AER。它抛出了 10 个警告，类型为In readLines(file, skipNul = TRUE) : cannot open compressed file '/usr/lib/R/site-library/[package]/DESCRIPTION', probable reason 'No such file or directory'where [package]is abind, colorspace, dichromat... (但不是AER)。
从那时起example('AER')就会引发警告：no help found for ‘AER’。
我已经删除并重新安装了 R 4.0：它没有帮助。此外，还apt purge r-base* r-recommended r-cran-*发出了警告：dpkg: warning: while removing r-base-core, directory '/usr/lib/R/site-library' not empty so not removed。此外，还有一堆Package [package] is not installed, so not removed，包括[package]等于r-cran-abind和上面列出的其他（这purge也返回了一堆Note, selecting [package] for glob 'r-cran-*'）。
我还没有尝试过不使用 RStudio 来使用 R。我可能在升级到 Ubuntu 20.04 期间正在使用 RStudio。另外，我不记得这个问题是在我升级 R 和 RStudio 之后（这是我最好的猜测）还是在我升级 Ubuntu 之后（一两天后）开始的。
我希望有人能帮帮忙。
答案1
解决方案是通过r-sig-debian 邮件列表作者为 Dirk Eddelbuettel 和 Sébastien Villemot。
我不知道这是否有必要，但我首先这样做了：
sudo update-alternatives --config libblas.so.3-x86_64-linux-gnu
并选择/usr/lib/x86_64-linux-gnu/blas/libblas.so.3（而不是pthread）。
然后（这有效）：
sudo apt install libopenblas-openmp-dev
sudo apt remove libopenblas-pthread-dev libopenblas0-pthread