我已经尝试为 phyton 2.7.5 安装 numpy 和 scipy 了,我需要这个版本的 python,因为我的最终目标是安装类(http://class-code.net/) 和 montepython (http://montepython.net/)。
(我有 ubuntu 12.04)
当我尝试导入 numpy 或 scipy 时每次都会出现以下错误:
$ phyton2.7
>>> import numpy
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
import add_newdocs
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
from type_check import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
import numpy.core.numeric as _nx
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
import multiarray
ImportError: /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/multiarray.so: undefined symbol: PyUnicodeUCS4_AsUnicodeEscapeString
>> import scipy
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/__init__.py", line 78, in <module>
from numpy import show_config as show_numpy_config
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
import add_newdocs
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
from type_check import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
import numpy.core.numeric as _nx
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
import multiarray
ImportError: /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/multiarray.so: undefined symbol: PyUnicodeUCS4_AsUnicodeEscapeString
为了消除错误我曾尝试过:
- 满足python要求:
$ sudo apt-get install build-essential python-dev gfortran
- 使用 apt-get 安装:
$ sudo apt-get install python-numpy python-scipy python-matplotlib ipython ipython-notebook python-pandas python-sympy python-nose
- 使用 pip 安装要求:
$ sudo pip install requests
$ sudo pip install numpy
...并尝试使用 pip 安装:$ sudo pip install scipy
- 我已经有环境变量:
export PYTHONPATH=/usr/lib/python2.7/dist-packages:${PYTHONPATH}
上次我安装 numpy 和 scipy(在旧版 ubuntu 10.x 中)时,这个对我有用。 sudo sh -c "wget http://python-distribute.org/distribute_setup.py -O- | python"
sudo sh -c "wget https://raw.github.com/pypa/pip/master/contrib/get-pip.py -O- | python"
然后使用 pip 安装它们,如(4)但现在看来python-distribute.org已关闭。我收到以下错误:
http://python-distribute.org/distribute_setup.py Resolving python-distribute.org (python-distribute.org)... failed: Name or service not known. wget: unable to resolve host address `python-distribute.org'
我也曾尝试从 synaptic 和 Ubuntu 软件中心安装 numpy 和 scipy
我每次尝试都失败了,现在我不知道该怎么办。我是不是漏掉了什么?如何才能为 Python 正确安装 numpy 和 scipy?任何想法都将不胜感激。
当我做
echo $PYTHONPATH
我明白了
/usr/lib/python2.7/dist-packages
答案1
好的,让我们按照安装指南:
它说你需要 python 2.7 (你已经有了):
$ python --version Python 2.7.4
然后它说你也需要 numpy 包,版本 >= 1.4.1:
apt-cache 策略 python-numpy python-numpy: 已安装:(无) 候选:1:1.7.1-1ubuntu1 版本表: 1:1.7.1-1ubuntu1 0 500 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/raring/main amd64 软件包
如你所见,我有可用的 numpy 版本 1.7.1,因此让我们继续安装它:
sudo apt-get install python-numpy
现在它说我们需要 cython,让我们检查该包是否可用:
apt-cache 策略 cython cython: 已安装:(无) 候选版本:0.17.4-0ubuntu1 版本表: 0.17.4-0ubuntu1 0 500 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/raring/main amd64 软件包
我们有它,我们安装它:
sudo apt-get install cython
请注意,还有其他依赖包也正在安装。
奇怪的是,我们还需要 scipy 模块:
sudo apt-get install python-scipy
测试. 在终端中打开 python 并输入以下内容:
$ python Python 2.7.4 (default, Sep 26 2013, 03:20:26) [GCC 4.7.3] on linux2 Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information. >>> import numpy >>> import scipy >>> import cython >>> exit()
以上,必须没有错误。如果出错了,请重新阅读指南,你忘记/跳过了一步。
从其页面下载 CLASS 源代码,转到终端中的目录,解压并制作它:
cd 其中/tar/是 tar zxf 类_v2.0.2.tar.gz cd 类_v2.0.2 制作
在这里我们将等待完成。完成后,我们转到 python 目录并启动魔法。无需从目录移动,运行以下命令:
光盘python python setup.py 构建 python setup.py 安装--用户
现在我们已经在用户目录中安装了 CLASS。我们应该测试一下!
python Python 2.7.4 (default, Sep 26 2013, 03:20:26) [GCC 4.7.3] on linux2 Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information. >>> from classy import Class >>> exit()
到目前为止,一切都很舒适。
现在是真相时刻,将 monthypython tarball 下载到你的代码目录中:
光盘〜 mkdir 代码 CD 代码 wget https://www.dropbox.com/s/l7mnhwsktp1m8b5/montepython_v1.2.5.tar.bz2?dl=1 -O montepython_v1.2.5.tar.bz2 焦油 jxf montepython_v1.2.5.tar.bz2
在安装说明中有一些笔记在这种特殊情况下(新安装),这并不相关,但当您更新 montepython 时它可能很重要。
这个更改很重要。你还记得你在哪里安装了 CLASS 吗?现在你应该告诉 Monte Python 它在哪里。在我的例子中是
/home/braiam/src/class_v2.0.2/class
,你的可能不同。你可以使用find
它来查找它:find ~ -name class -print
好吧,现在我
default.conf
使用任何你喜欢的方法(我将使用 nano)来修改文件并修改路径root
,因此完整的文件将如下所示:# Fill in the relevant path to your personal distribution. # If you create a new file out of this one, please remember to call # MontePython.py with the option '-conf my.conf' # At minimum, this file should contain one line: # ** path['cosmo'] = path to the cosmological code you are using. Note, if you are # using a modified version of class, be sure that the path contains the word # class, otherwise the code might not recognise it. # If you want to use a data folder different from the one present in the folder # you are executing the code, please also add: # ** path['data'] = /path/to/the/other/data/ root = '/home/braiam/src/class_v2.0.2/' path['cosmo'] = root+'/class/'
保存文件并退出。
测试 montepython!如果一切正常,您应该能够
code/MontePython.py --help
在 montepythong 目录中运行,并且一切都应该运行:~/src/montepython$ code/MontePython.py --help 用法:MontePython.py [-h] [-N 步骤数] [-o 输出文件夹] [-p 输入参数文件] [-c 输入 cov 矩阵] [-j 跳跃方法] [-f 跳跃因子] [-conf 配置文件] [-chain_number链号] [-r 从链重新启动] [-bf 从最适合的文件重新启动] [-info [计算所需文件的信息 [计算所需文件的信息 ...]]] [-bins 所需的箱数,默认为 20] [-no_mean] [-comp 比较文件夹] [-满足自定义需求的额外绘图文件] [-noplot] [-all] [-ext 更改输出文件的扩展名] [-fontsize 所需字体大小,默认为 15] [-ticksize 所需刻度尺寸,默认为 13] Monte Python,Python 中的蒙特卡洛代码 可选参数: -h, --help 显示此帮助消息并退出 -N 步数 -o 输出文件夹 -p 输入参数文件 -c 输入cov矩阵 -j 跳跃方法 -f 跳跃因子 -conf 配置文件 -chain_number 链号 -r 从链重新启动 -bf 从最适合的文件重新启动 -info [计算所需文件的信息 [计算所需文件的信息 ...]] -bins 所需的箱数,默认为 20 -no_mean -comp 比较文件夹 - 满足定制需求的额外绘图文件 -noplot -全部 -ext 更改输出文件的扩展名 -fontsize 所需字体大小,默认为 15 -ticksize 所需的刻度大小,默认值为 13
这样,您就已经安装好了 montepython 并且准备开始运行了!