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libjvm.so：无法打开共享对象文件：没有此文件或目录

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libjvm.so：无法打开共享对象文件：没有此文件或目录

尝试在我的 14.10 ubuntu 上使用此代码在 R 上安装 rJava 包

if (!require(rJava)) install.packages('rJava')

出现了一些与 java 相关的错误，包括 jni 问题，重新安装 jdk 后，尝试再次运行相同的代码，出现了该错误

Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/usr/local/lib/R/site-library/rJava/libs/rJava.so':
  libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory
Error: loading failed
Execution halted
ERROR: loading failed
* removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/rJava’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘rJava’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/RtmpfFjrp0/downloaded_packages’
Warning message:
In library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE,  :
  there is no package called ‘rJava’

寻找解决方案，发现几乎每个人都建议（对于 x64）执行这些命令

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/jvm/java-8-oracle/lib/amd64:/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server
sudo R CMD javareconf

但那没用，我还能做什么？我会提供任何需要的详细信息，在整个机器上搜索 libjvm.so 会导致此结果

/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server/libjvm.so
/usr/lib/jvm/jdk1.8.25/jre/lib/amd64/server/libjvm.so
/usr/local/java/jre1.7.0_75/lib/amd64/server/libjvm.so

答案1

执行以下操作应该可以解决您的问题：

$ export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server
$ sudo R CMD javareconf

答案2

有时你需要这个R CMD javareconf -e

看https://stackoverflow.com/a/13446026/2803344

答案3

脚步：

  1. 找到您的 R 位置。它将存储在文件rsession-ld-library-path中rserver.conf。或者只需执行which R。位置通常是/usr/lib64/R/lib或/usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/lib

  2. 查找libjvm.so文件，该文件通常位于usr/lib/jvm/java-8-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server路径中，具体取决于您使用的 jre。检查echo $JAVA_HOME。

  3. 使用创建符号链接ln -s sudo ln -s /usr/lib/jvm/java-8-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so /usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/lib/libjvm.so

  4. 重启 R 服务器

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