我对 ubuntu 还很陌生,我正在尝试学习如何使用 vcftools 过滤 SNP 数据。尝试运行我的代码后,我不断收到相同的错误:Stat 错误:没有这样的文件或目录,错误:无法确定 Practice.populations.snps.vcf 的文件类型
我尝试重命名我的工作目录并再次尝试,我仔细检查了我的文件实际上是一个 vcf,但似乎没有任何效果。
(基础)sample@sample-VirtualBox:~/Practice.Oct.20$ vcftools --vcf Practice.populations.snps.vcf --max-missing 0.05 --recode --recode-INFO-all --out prac.mm
VCFtools - 0.1.16 (C) Adam Auton 和 Anthony Marcketta 2009
参数解释:--vcf Practice.populations.snps.vcf --recode-INFO-all --max-missing 0.05 --out prac.mm --recode
stat 错误:没有此文件或目录错误:无法确定 Practice.populations.snps.vcf (base) 的文件类型sample@sample-VirtualBox:~/Practice.Oct.20$