公司里的一台 PC 机有三个 16x pci-e 插槽，我们称之为 ABC（A 最靠近 CPU，C 最远）。它安装了两张显卡（A 上是 gtx680，C 上是 gtx560，都用于某种 gpu 计算），并且都运行良好。
然后我们自己开发新的pci-e卡，用来获取外界的一些数据。
那么问题来了，如果三个槽都用上（新卡装在B槽），大多数情况下电脑会无法启动（偶尔能启动，但是新卡无法被OS识别）。
然后我们做了一些实验：
如果我们移除 A 中的显卡，PC 将可以正常启动，新卡无论在 A 还是 B 中都能正常工作。
如果我们移除新卡并在 B 中安装 gtx680，PC 也将启动（通过观察键盘状态和 HD 活动指示器），但没有显示，可能需要进行一些配置。
如果我们在 A 中安装新卡并在 B 中安装 gtx680，PC 也无法启动。
那么，问题的可能原因是什么？我需要做更多研究吗？关于什么？
我希望我已经表达清楚了，任何建议都会受到赞赏。
编辑：
我们使用的 PSU 标记为 1000W，此外，当我们使用两个 gpu 配置时，当 680 被某些 cuda 应用程序充分利用时，PC 可以正常工作一整天而不会出现任何问题。
编辑2：
我们开发的卡可以在其他带有板载显卡的普通电脑（联想或戴尔）上使用。问题机器不是戴尔、联想等知名品牌。其主板标有 EVGA。
答案1
无耻的剽窃Chris S 的精彩回答在 Server Fault 上关于 PCI-e 规格的类似问题：
应该：PCIe 规范规定所有插槽都从 1x 开始，并规定可以使用多少条通道。谁的通道更多并不重要，有些插槽设计用于容纳更大的卡，而较小的卡则适合更大的插槽。无论双方可以以多快的速度进行通信（通道数和时钟/版本），都将协商并使用该速度。
事实：通常应该发生的事实际上就是那样发生的。。但有相当多的主板（尤其是发烧级主板）不符合规格。有些主板在第一个 PCIe 插槽中只使用 16x 显卡。其他主板无法正确自动协商。在服务器级硬件中，这些问题非常罕见，但确实会发生。
基本上，很多主板并不完全遵循 PCI-e 规格。我曾遇到过 8x RAID 控制器的问题。这款特定的台式机主板只有一个 PCI-e x16 插槽，其余的都是 x4 或 x1；所以我唯一的选择是 x16 插槽。但主板会仅有的在该插槽中接受显卡，因此我们最终不得不用更高端的主板替换该主板。
现在，你没有提到这个硬件在哪里运行。如果它在品牌服务器中运行，或者有一个通用的服务器级主板（比如 Super Micro、Tyan 等），那么这可能是不是你的问题。
但如果这是在 Gigabyte 或 Asus 主板（或类似产品）上运行的，那么我建议简单地尝试另一个主板，因为它很可能只允许在 x16 插槽中插入显卡，或者只接受插槽中某些奇怪的显卡/其他卡的组合。
答案2
混合使用 Nvida 和 ATI 可能会有问题。SLI 桥接器的连接方式可能是原因之一。电源是否供电不足。
我认为这里没有足够的信息。第三张卡也是 Nvida 卡还是 ATI 卡？正如 Sathya 指出的那样，电源。在 Sli 中运行卡？
更多细节可能有助于找到解决方案。