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正确设置LD_LIBRARY_PATH

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正确设置LD_LIBRARY_PATH

我正在使用 Docker 和 Ubuntu 16.04 的映像。我正在使用这个 docker 来运行：

  • 借助 boost.python 在 python 中导入 C++ 类
  • 借助 Matlab Runtime (MCR) 在 python 中导入 matlab 的 python 包。

在 docker 中安装 MCR 之前，我已经使用以下命令安装了 boost：

$ sudo apt-get install -y libboost-all-dev

我能够包装 C++ 类并在 python 中调用它们。然后我安装了 MCR，要求之一是设置LD_LIBRARY_PATH为 Matlab 的库。

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64

它有效，我能够在 python 中运行 matlab 的 python 包，但测试 C++ 类包装器由于LD_LIBRARY_PATH.例如，当我尝试在 python 中导入 C++ 类时，出现以下错误：

 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpython3.4m.so.1.0: undefined symbol: XML_SetHashSalt

如果我取消LD_LIBRARY_PATH设置 C++ 导入有效，但 MCR 失败。那么问题LD_LIBRARY_PATH是，为了成功运行 C++ 类和 Matlab 的 python 包，应该怎样做呢？

我尝试添加增强库的路径LD_LIBRARY_PATH但没有成功，因此 env 值将是：

/usr/lib/x86_64-linux-gnu:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64

编辑

设置之前C++库文件的依赖关系LD_LIBRARY_PATH：

    linux-vdso.so.1 (0x00007ffcee0dc000)
    libpython3.4m.so.1.0 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpython3.4m.so.1.0 (0x00007f9d69e59000)
    libboost_python-py34.so.1.55.0 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libboost_python-py34.so.1.55.0 (0x00007f9d69c09000)
    libstdc++.so.6 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6 (0x00007f9d698fe000)
    libm.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libm.so.6 (0x00007f9d695fd000)
    libgcc_s.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libgcc_s.so.1 (0x00007f9d693e7000)
    libc.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6 (0x00007f9d6903c000)
    librt.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/librt.so.1 (0x00007f9d68e34000)
    libexpat.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libexpat.so.1 (0x00007f9d68c0b000)
    libz.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libz.so.1 (0x00007f9d689f0000)
    libpthread.so.0 => /lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0 (0x00007f9d687d3000)
    libdl.so.2 => /lib/x86_64-linux-gnu/libdl.so.2 (0x00007f9d685cf000)
    libutil.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libutil.so.1 (0x00007f9d683cc000)
    /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x00007f9d6a6c3000)

设置后the LD_LIBRARY_PATH：

    linux-vdso.so.1 (0x00007ffc42e9b000)
    libpython3.4m.so.1.0 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpython3.4m.so.1.0 (0x00007fad9635b000)
    libboost_python-py34.so.1.55.0 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libboost_python-py34.so.1.55.0 (0x00007fad9610b000)
    libstdc++.so.6 => /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64/libstdc++.so.6 (0x00007fad95d8a000)
    libm.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libm.so.6 (0x00007fad95a89000)
    libgcc_s.so.1 => /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64/libgcc_s.so.1 (0x00007fad95873000)
    libc.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6 (0x00007fad954c8000)
    librt.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/librt.so.1 (0x00007fad952c0000)
    libexpat.so.1 => /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64/libexpat.so.1 (0x00007fad95095000)
    libz.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libz.so.1 (0x00007fad94e7a000)
    libpthread.so.0 => /lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0 (0x00007fad94c5d000)
    libdl.so.2 => /lib/x86_64-linux-gnu/libdl.so.2 (0x00007fad94a59000)
    libutil.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libutil.so.1 (0x00007fad94856000)
    /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x00007fad96bc5000)

答案1

您有几个选择：

  1. 在上面的语句中添加共享库的路径前缀export（您的系统上很可能$LD_LIBRARY_PATH没有设置，因此唯一设置的路径是在导出语句中显式设置的路径。）

     export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/lib/:/usr/lib/:/usr/lib64/:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64

    该export语句不会成为 shell 会话的永久部分，除非您将其添加到.bashrc仅供参考。

  2. 添加 MATLAB 库路径/etc/ld.so.conf.d/并运行ldconfig以识别系统上链接器的新路径。

    （顺便说一句，我猜测MATLAB库名称。您可能需要将文件名命名为MATLAB全小写或其他名称以外的名称。基本上，我们需要库的名称，因为它在链接过程中被引用。您可以检查 make 文件以了解如何引用它。）

     # Add the file '/etc/ld.so.conf.d/MATLAB' with the following lines 
 /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64
 /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64
 /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64
 /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64

    然后运行ldconfig。

     sudo ldconfig

    您可能需要取消设置该$LD_LIBRARY_PATH变量以使链接器使用正常的系统搜索路径并选择 MATLAB 的新搜索路径。

     unset LD_LIBRARY_PATH

答案2

它对我有用的唯一方法是定义LD_PRELOAD并将其指向系统库。所以我当前的环境是：

LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/opengl/lib/glnxa64
LD_PRELOAD=/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libexpat.so

因此，在 docker 中，我创建了一个.matlab包含上述环境变量的文件。然后，在 dockerfile 中我添加了以下内容：

services:
  django: &django
    build:
      context: .
      dockerfile: ./compose/local/django/Dockerfile
    depends_on:
      - postgres
    volumes:
      - .:/app
      - shared_upload_tmp:/app_temp
      - media:/app/computation_server/media
    env_file:
      - ./.envs/.local/.django
      - ./.envs/.local/.postgres
      - ./.envs/.production/.matlab
    ports:
      - "8800:8000"
    command: /start

答案3

我的工作站上也有类似的问题。为了解决这个问题，我在此路径下创建了一个文件夹/usr/lib/GLops，然后GL libraries从台面转速并将它们放入该目录中。最后，我添加了以下几行~.tcshrc

setenv LD_LIBRARY_PATH /usr/lib64/GLops/libGL.so
setenv LIBGL_ALWAYS_SOFTWARE 1
setenv LIBGL_ALWAYS_INDIRECT 1
setenv LIBGL_DIR3_DISABLE 1
setenv MESA_GL_VERSION_OVERRIDE 2.1

该路径/usr/lib64/GLops/包含以下文件：

libGL.so  libGL.so.1  libGL.so.1.2.0  libxcb.so  libxcb.so.1  libxcb.so.1.1.0

我拥有的库/usr/lib64/GLops:/usr/lib/GLops

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