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使用文件列表将脚本应用于一组类似名称的文件 (unix)

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使用文件列表将脚本应用于一组类似名称的文件 (unix)

我有一组文件的名称如下：

NAM11_BW415_R1.fastq.gz         NAM13_BW968_R2.fastq.gz     NAM17_AC_Barrie_R1.fastq.gz  NAM3_PI648600_R2.fastq.gz  NAM7_Glenlea_R1.fastq.gz   PI648598_R2.fastq.gz
NAM11_BW415_R2.fastq.gz         NAM13_Frontana_R1.fastq.gz  NAM17_AC_Barrie_R2.fastq.gz  NAM3_PI648842_R1.fastq.gz  NAM7_Glenlea_R2.fastq.gz   PI648611_R1.fastq.gz
NAM11_Reeder_R1.fastq.gz        NAM13_Frontana_R2.fastq.gz  NAM17_BW388_R1.fastq.gz      NAM3_PI648842_R2.fastq.gz  NAM7_Laura_R1.fastq.gz     PI648611_R2.fastq.gz
NAM11_Reeder_R2.fastq.gz        NAM14_BW874_R1.fastq.gz     NAM17_BW388_R2.fastq.gz      NAM4_PI613279_R1.fastq.gz  NAM7_Laura_R2.fastq.gz     PI648672_R1.fastq.gz
NAM11_Webill_R1.fastq.gz        NAM14_BW874_R2.fastq.gz     NAM17_RedFife_R1.fastq.gz    NAM4_PI613279_R2.fastq.gz  NAM7_Marquis_R1.fastq.gz   PI648672_R2.fastq.gz
NAM11_Webill_R2.fastq.gz        NAM14_Glenn_R1.fastq.gz     NAM17_RedFife_R2.fastq.gz    NAM4_PI613280_R1.fastq.gz  NAM7_Marquis_R2.fastq.gz   PI648724_R1.fastq.gz
NAM12_BW431_L002_R1.fastq.gz    NAM14_Glenn_R2.fastq.gz     NAM1_PI648517_R1.fastq.gz    NAM4_PI613280_R2.fastq.gz  NAM8_FL62R1_R1.fastq.gz    PI648724_R2.fastq.gz
NAM12_BW431_L002_R2.fastq.gz    NAM14_Unity_R1.fastq.gz     NAM1_PI648517_R2.fastq.gz    NAM4_PI648524_R1.fastq.gz  NAM8_FL62R1_R2.fastq.gz    PI648768_R1.fastq.gz
NAM12_BW431_L008_R1.fastq.gz    NAM14_Unity_R2.fastq.gz     NAM1_PI648519_R1.fastq.gz    NAM4_PI648524_R2.fastq.gz  NAM8_Muchmore_R1.fastq.gz  PI648768_R2.fastq.gz

我想使用一个脚本，该脚本接受每个文件的两个参数（R1 和 R2），并在每批可能有 16 个文件/进程上执行此操作。我该如何执行此操作，因为即使文件看起来像这样，我也想将其推广到任何可能看起来相似或具有以 R1 和 R2 结尾的文件集的文件夹。

我希望将文件分成两个组（同名）并将它们发送到一个脚本，该脚本将在它们所在的位置创建一组文件夹，并且在该组文件夹中，脚本将执行一堆命令

到目前为止，我所拥有的代码对于第一个文件来说是可以的，但随后它开始在同一个文件夹中执行相同的过程，而不是跨不同制作的文件夹执行此操作。

因此，我想要的代码是获取两个名称相似的文件并在它们上应用一组脚本。如果我们也可以一次取 8 个，完成后开始下一批，那就更好了。

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