我的 HPDC 上的 maxquant 软件似乎没有利用我的 m.2 raid 驱动器的速度

我的 HPDC 上的 maxquant 软件似乎没有利用我的 m.2 raid 驱动器的速度

我正在使用一款名为 MaxQuant v. 1.6.6 的软件来分析蛋白质组数据。所讨论的计算机具有以下规格:

  • 技嘉x299主板
  • i9-7980 芯片(18 核,36 个逻辑核,2.6 GHz,但运行速度约为 4.4 GHz)
  • 64 GB 内存
  • 2 个三星 m.2 1 TB 硬盘设置为 RAID 0,仅用于处理数据
  • 1 台三星 SSD 仅用于操作系统和其他软件
  • 1 个 12TB 标准 7200rpm 硬盘用于备份

MaxQuant 是一个独立软件包,运行于其自己的文件夹中。但是,它使用 .NET Framework。我的问题是,当我在 RAID 驱动器上运行该软件时,我几乎看不到我期望的速度。几乎就像有什么东西限制了它达到全速的能力。这可能是 .NET 问题吗?.NET Framework 安装在 OS 驱动器上。

使用 ATTO 基准测试,我看到 RAID 以 2.9 Gb/s 的速度运行,但是在软件运行时我没有看到超过 200 Mb/s 的速度?

答案1

我猜测 2.9Gb/s 是串行写入速度,但 MaxQuant 从来不会真正一次性写入大量数据,而是定期写入小块数据,这可能使平均写入速度比串行写入速度慢得多。

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