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帮助使用 bash 循环合并文件

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帮助使用 bash 循环合并文件

我是 bash 新手，有一个文本（.txt）文件列表，我想将其合并在一起，如下所示：

1.unmapped.F.fq
1.unmapped.R.fq
1.unmapped.s.fq
2.unmapped.F.fq
2.unmapped.R.fq
2.unmapped.s.fq

我想将 F/R/s 文件合并在一起以创建如下所示的输出：

1.unmapped.all.fq
2.unmapped.all.fq

我使用类似的方法在 R 中合并了更简单的命名文件

for(i in 1:10){
  data <- paste0("A.",i)
  assign(paste0("data",i), read.csv(data))
}

但我不确定在 bash 中该怎么做，因为有 2 个地方的输入不断变化（1/2 和 F/R/s），或者循环是否是最好的方法。

答案1

如果我理解正确的话，请尝试以下操作：

for i in {1..2}; do # 1 to 2 just to match with the sample posted
  cat "$i".unmapped.{F,R,s}.fq >> "$i".unmapped.all.fq
done

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