我将文件 1 中的第 7,8 和 9 列复制到文件 2 中的第 7,8 和 9 列中，生成一个新文件 3。生成的文件（文件 3）未与原始文件对齐，如何编辑它以保留结盟 ？
我使用了命令：
awk '(getline line < "file 1") > -1 {split(line,a); $7 = a[7]; $8 = a[8]; $9= a[9]} 1' file 2 > file 3
文件1：
GRM in vacuum
192700
1GRM C1 1 17.188 0.311 13.994 -0.5971 0.0204 -0.0724
1GRM C2 2 0.094 0.383 0.005 0.4831 -0.8709 -0.2204
1GRM C3 3 0.091 0.524 0.008 -0.7098 0.3449 -0.3952
文件2：
GRM in vacuum
192760
1GRM C1 1 0.061 0.071 14.000
1GRM C2 2 0.184 0.142 14.000
1GRM C3 3 0.184 0.284 0.000
文件3（输出）：
GRM in vacuum
192760
1GRM C1 1 0.061 0.071 14.000 -0.5971 0.0204 -0.0724
1GRM C2 2 0.184 0.142 14.000 0.4831 -0.8709 -0.2204
1GRM C3 3 0.184 0.284 0.000 -0.7098 0.3449 -0.3952
为了解决对齐问题，我使用了：
awk 'BEGIN{fmt="%10s%9s%7d%8.3f%8.3f%8.3f%8.4f%8.4f%8.4f"} (getline line < "file 1") > -1 {n = split(line,a)} n > 6 {$0 = sprintf(fmt,$1,$2,$3,$4,$5,$6,a[7],a[8],a[9])} 1' "file 2" > file 3
但我仍然有两个问题。
第一个问题是输出文件中列的对齐方式与原始文件（文件 1 和文件 2）不同。
第二个问题发生在第 10002 行，第 2 列和第 3 列合并在一起，导致输出文件中从第 10002 行开始到末尾的完整列消失，下面是第 10002 行的 3 个文件：
文件1：
2500GRM C3 9999 15.716 8.242 0.002 0.2372 -0.2989 -0.0758 # line 10001
2500GRM C410000 15.592 8.311 0.003 0.2603 -0.2492 -0.2394 # line 10002
2501GRM C110001 15.591 8.453 0.006 0.0887 -0.2458 -0.7014 # line 10003
2501GRM C210002 15.714 8.524 0.007 -0.0788 0.0598 -0.9619 # line 10004
文件2：
2500GRM C3 9999 15.433 8.378 0.000 # line 10001
2500GRM C410000 15.310 8.449 0.000 # line 10002
2501GRM C110001 15.310 8.591 0.000 # line 10003
2501GRM C210002 15.433 8.662 0.000 # line 10004
文件3：
2500GRM C3 9999 15.433 8.378 0.000 0.2372 -0.2989 -0.0758 # line 10001
2500GRM C410000 15.310 8.449 0.000 -0.2492 -0.2394 # line 10002
2501GRM C110001 15.310 8.591 0.000 -0.2458 -0.7014 # line 10003
2501GRM C210002 15.433 8.662 0.000 0.0598 -0.9619 # line 10004
我已在以下链接中附加了所有文件：
https://drive.google.com/drive/folders/13diMVxlp-T9BXE_jnm_LL1jUPbz8eren
答案1
问题是 中 有 8 或 9 个数据字段，file1中有 5 或 6 个数据字段file2。要么C3 9999
是一个格式错误的字段，要么C410000应该是两个字段C4和10000。
要根据字段数量调整格式，您可以
- 使用两个格式字符串并在它们之间切换
n分割行并取最后三个值时保存数组元素的数量a[n-2],a[n-1],a[n]
awk '
BEGIN{
fmt1="%8s %6s%5s %7.3f %7.3f %7.3f %7.4f %7.4f %7.4f" ORS
fmt2="%8s %11s %7.3f %7.3f %7.3f %7.4f %7.4f %7.4f" ORS
}
(getline line < "file 1") > -1{
n=split(line, a)
}
NF<=3{ print; next } # print original line
NF==6{ printf fmt1, $1, $2, $3, $4, $5, $6, a[n-2], a[n-1], a[n]; next } # 6 + 3 fields
{ printf fmt2, $1, $2, $3, $4, $5, a[n-2], a[n-1], a[n] } # 5 + 3 fields
' "file 2" > "file 3"
输出：
...
2500GRM C3 9999 15.433 8.378 0.000 0.2372 -0.2989 -0.0758
2500GRM C410000 15.310 8.449 0.000 0.2603 -0.2492 -0.2394
2501GRM C110001 15.310 8.591 0.000 0.0887 -0.2458 -0.7014
2501GRM C210002 15.433 8.662 0.000 -0.0788 0.0598 -0.9619
...