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Sun Grid Engine 作业文件中内存请求的语法

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Sun Grid Engine 作业文件中内存请求的语法

qsub在使用 登录节点后，我正在大学集群中提交一份 Matlab 作业ssh。

该作业内存不足。这是我收到的解决问题的建议：“可能的解决方案是在更大的机器上运行或购买更多 RAM”。

这对于我的 bash 文件来说实际上意味着什么？ bash 文件的哪几行控制机器或 RAM 的大小？目前，在我的 bash 文件（见下文）中，我请求vmem和tmem.有这些 RAM 吗？

#$ -S /bin/bash
#$ -l h_vmem=18G
#$ -l tmem=18G
#$ -l h_rt=480:0:0
#$ -cwd
#$ -j y

#Run 600 tasks where each task has a different $SGE_TASK_ID ranging from 1 to 600
#$ -t 1-600

#$ -N try
date
hostname


#Output the Task ID
echo "Task ID is $SGE_TASK_ID"

matlab -nodisplay -nodesktop -nojvm -nosplash -r "main_1; ID = $SGE_TASK_ID; f_1; exit"

答案1

以开头的行将#$被 忽略bash。它们是qsub排队系统的命令。任何以 an 开头的行#都会被 bash 忽略，qsub具体来说，使用#$来指示它自己的参数。

就您而言，您的管理员已对其进行了设置，因此它可以采用这两个似乎与内存有关的参数：

#$ -l h_vmem=18G
#$ -l tmem=18G

您需要与您正在使用的服务器的管理员交谈，并要求他们告诉您如何调整这些值，或使用另一个标志来请求更多内存。详细信息将特定于您的设置，因此我们无法提供更多帮助。

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