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texshade：错误！段落在 \inf@@get 完成之前结束

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texshade：错误！段落在 \inf@@get 完成之前结束

我正在尝试使用 texshade 渲染多个对齐，但该包似乎存在问题。尝试使用文件时，控制台会输出以下内容：

失控的论点？
！段落在 \inf@@get 完成之前结束。

\par
l.13 \begin{texshade}{Result.fasta_aln enter code here}
？

我尝试过 texshade 1.25 和 1.26 版本，但在 MSF 或 fasta_aln 文件中均无所获。
这里有一个最小的 tex 工作示例：

    \documentclass[
]{article}

\usepackage{texshade}

\begin{document}

\begin{texshade}{Result.fasta_aln}
\hideconsensus
\end{texshade}

\end{document}

Result.fasta_aln的内容为：

>1aboA
NL-FVAL---YDFVASGDNTLSITKGEKLR-------VLGYNH-------NGEWCE--AQTKNGQGWVPSNYITPV-N--
---
>1ycsB
KGVIYAL---WDYEPQNDDELPMKEGDCMT-------IIHREDED-----EIEWWW--ARLNDKEGYVPRNLLGLY----
--P
>1pht
GYQYRAL---YDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKK
ISP
>1vie
DR-----------VRKK--SGAAWQGQIVGWYCTNLTPEGYAVESEAHPGSV-------------QIYPVAALERI----
--N
>1ihvA
NF-RVYYRDSRDPVWKGPAK-LLWKGEGAV-------VIQDNS-------DIK-------------VVPRRKAKIIRD--
---

通过 .sty 文件可以找到 \inf@@get，但我不知道它为什么会失败（有人会认为是某种转义字符交互？）。有趣的是，在我运行 Linux 的桌面上尝试同样的操作没有出现任何问题。

以下是 .sty 文件中包含的定义：

\def\inf@@get#1 #2 #3 #4 #5 #6@{%
   \def\first@{#1}
   \def\second@{#2}
   \def\third@{#3}
   \xdef\fourth@{#4 @}
   \expandafter\check@letter\fourth@
   \ifnumber
      \def\fourth@{#4}
   \else
      \xdef\fourth@{#5 @}
      \expandafter\check@letter\fourth@
      \ifnumber
         \def\fourth@{#5}
      \else
         \def\fourth@{99999999}
      \fi
   \fi
   \def\fifth@{#5}
   \def\last@{#6}}

这里使用的命令是：

\expandafter\inf@@get\msfline

在 Overleaf 上尝试（使用）会导致同样的错误，损坏的输出作为图像附加。还会弹出一个额外的错误：

Misplaced alignment tab character &.
\msfline ->\par &
                      & & & @
    l.24 {result.fasta_aln}

在此处输入图片描述

答案1

我发现有人在 CTAN 的 Texshade 包的评论中发布了这个解决方案：

在 CTAN 上打包 texshade

修复使用 TeXshade v1.26 时遇到的错误：

  1. 在您的系统上找到文件 texshade.sty。这可能因您安装 LaTeX 的方式而异。
  2. 找到以下行（应该是 2021/04/01 发布的 v1.26 中的第 156 行）：\xdef\par@{\expandafter\string\par}
  3. 用以下两行替换它：\xdef\par@{\par} \xdef\par@{\expandafter\string\par@}

现在就可以工作了。

应用此方法后，我还注意到，如果您同时使用 Textopo 包，它会引发更多错误 编辑：在 CTAN textopo 页面上，有针对此其他情况的类似修复。CTAN 的 Textopo

否则它工作正常。

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