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从另一个文件中删除同名的行

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从另一个文件中删除同名的行

我有以下列表：

NM_000014 3
NM_000015 0
NM_000016 0
NM_000017 0
NM_000018 0
NM_000019 28
NM_000020 0
NM_000021 0
NM_000022 0
NM_000023 0
NM_000024 8
NM_000025 0
NM_000026 0

我还有另一个仅包含第一列的文件：

NM_000031
NM_000032
NM_000033
NM_000034
NM_000022
NM_000035
NM_000036
NM_000037
NM_000023
NM_000038
NM_000039
NM_000040
NM_000041
NM_000042

我想删除第一个文件中被命名为第二个文件的整行。在这种情况下，输出文件将是：

NM_000014 3
NM_000015 0
NM_000016 0
NM_000017 0
NM_000018 0
NM_000019 28
NM_000020 0
NM_000021 0
NM_000024 8
NM_000025 0
NM_000026 0

（删除 NM_000022 和 NM_00023 及其对应值）

谢谢！！

答案1

和awk：

awk 'NR==FNR {a[$0]; next}; {if ($1 in a) next}; 1' f1.txt f2.txt

输入仅包含一列的文件作为第一个参数，并将要检查（第一列）成员资格的文件作为第二个参数。

  • NR==FNR {a[$0]; next}，这里NR==FNR只对第一个文件成立，然后我们将每一行保存到数组中，a以便我们可以对第二个文件的第一个参数进行成员资格测试，然后我们转到下一行，而无需对第二个文件进行任何进一步的操作

  • {if ($1 in a) next}; 1将仅针对第二个文件（要检查的文件）执行，这里我们检查空格分隔的第一个参数是否在数组中a，如果存在则转到下一行，否则打印整行。

例子：

$ cat f1.txt 
NM_000031
NM_000032
NM_000033
NM_000034
NM_000022
NM_000035
NM_000036
NM_000037
NM_000023
NM_000038
NM_000039
NM_000040
NM_000041
NM_000042

$ cat f2.txt 
NM_000014 3
NM_000015 0
NM_000016 0
NM_000017 0
NM_000018 0
NM_000019 28
NM_000020 0
NM_000021 0
NM_000022 0
NM_000023 0
NM_000024 8
NM_000025 0
NM_000026 0

$ awk 'NR==FNR {a[$0]; next}; {if ($1 in a) next}; 1' f1.txt f2.txt
NM_000014 3
NM_000015 0
NM_000016 0
NM_000017 0
NM_000018 0
NM_000019 28
NM_000020 0
NM_000021 0
NM_000024 8
NM_000025 0
NM_000026 0

答案2

您还可以使用sedBash 循环。

此命令进行修改file1（创建备份file1.bak），删除以以下任何行开头的每一行file2：

while read line ; do sed -i.bak "/$line.*/d" file1 ; done < file2

答案3

这里的 'grep' 命令怎么样:)

grep -Fvf oneColumnedFile listFile > outfile

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